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Enregistrement W584874182 · doi:10.3978/j.issn.2305-5839.2015.03.54

Genetics of adolescent idiopathic scoliosis in the post-genome-wide association study era.

2015· article· en· W584874182 sur OpenAlexaff
Linlu Zhao, Darren M. Roffey, Suzan Chen

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueScoliosis diagnosis and treatment
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIdiopathic scoliosisGenome-wide association studyScoliosisGeneticsMedicineGenetic associationMedical geneticsAssociation (psychology)BiologyBioinformaticsSingle-nucleotide polymorphismGenotypePsychologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Recently, analyses of a genome-wide association study (GWAS) conducted in a Japanese population found several common susceptibility variants associated with adolescent idiopathic scoliosis (AIS) (1-3). The top variants identified from this GWAS reside in genomic regions with potentially etiologically relevant genes and have been replicated across multiple populations and ethnicities. As a result, genes involved in biological pathways that are now viewed as promising targets for downstream functional investigation include abnormal somatosensory function ( LBX1 ) (1), delayed ossification of the developing spine ( GPR126 ) (2), skeletal dysplasia ( SOX9 ) (3) and scoliosis associated with syndromic disease ( KCNJ2 ) (3), One of these variants, a single nucleotide polymorphism (SNP) in the 3’-flanking region of the LBX1 gene (rs11190878) (1), has been consistently replicated in several independent populations (4). Other GWASes have also identified novel AIS-associated variants, with some overlap among the top ranked SNPs, including rs11190878 (Albertsen et al ., 2014, ASHG conference abstract) (5).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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