Relative Expression of Anti-Oxidant Genes in Adult Human Progenitor and Mature Oligodendrocytes (S12.005)
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE:To compare expression of anti-oxidant related genes in mature oligodendrocytes(OLs) with their progenitors (OPCs) using cells isolated from adult non-inflamed CNS tissue samples. BACKGROUND:Oxidative stress is implicated as contributing to injury to OLs in multiple sclerosis lesions. Coincident injury of OPCs in such lesions could impact on potential for tissue repair. Previous in vitro studies show that human adult CNS derived OPCs are more vulnerable to stress induced injury than are mature cells and that in MS lesions there is a relatively greater loss of OPCs than OLs (Cui 2013). DESIGN/METHODS:Cell populations were isolated from surgically resected temporal lobe tissue samples using an initial trypsin/Percoll gradient step followed by a 2-day in vitro micro-titre plate adhesion step to remove microglia. OLs (A2B5- fraction) and OPCs (A2B5+ fraction) were then isolated using A2B5 antibody coated immune-magnetic beads. Aliquots of 3 separate samples were then collected in Trizol. Subsequently RNA was extracted and subjected to Affymetrix based microarrays. Anti-oxidant gene analysis was performed using Partek-6 genomic suite. RESULTS:Previous analysis had indicated overexpression of OPC vs. mature OL lineage genes as well as over-expression of external apoptotic pathway genes in the A2B5+ fraction (Cui 2013). Oxidative stress related genes more highly expressed in the A2B5- under the basal conditions included Super Oxide Dismutase 3 (SOD3), Glutathione S transferase alpha 5 (GSTA5), Glutathione S transferase alpha 1 (GSTA1), Dual Oxidase 1 (DUO1), Dual Oxidase 2 (DUO2), Eosinophil Peroxidase (EPX), Myeloperoxidase (MPO), Prostaglandin Enteroperoxide Synthase 1 (PTGS1), Metallothionen 1H (MT1H), Thioredoxin Reducatse 3 N (TXNRD3NB). Mean up-regulation values ranged for 1.4 - 1.8 (p<.05). CONCLUSIONS:The microarray results suggest that mature human OLs express a basal level of anti-oxidant genes that may contribute to their relative in- situ and in vitro resistance to stress compared to OPCs. Study Supported by: Multiple Sclerosis Society of Canada
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».