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Enregistrement W61689785

The genetic aetiology of otosclerosis in the population of Newfoundland and Labrador

2014· dissertation· en· W61689785 sur OpenAlexaboutno aff
Nelly Abdelfatah

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2014
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEar Surgery and Otitis Media
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOtosclerosisGeneticsExome sequencingSanger sequencingCandidate geneBiologyGenotypingExomeGenetic heterogeneityGeneMedicineDNA sequencingGenotypeMutationAudiologyPhenotype
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Otosclerosis is a common form of conductive and mixed hearing loss in Caucasian populations, with an estimated prevalence of 0.3-0.4%. Since 1998, eight loci have been mapped to otosclerosis in families with apparent autosomal dominant (AD) otosclerosis but none of the causative genes have been identified. Objective As no otosclerosis gene has yet been identified, the main objective of this thesis was to identify otosclerosis-disease causing genes by studying Newfoundland (NL) families. Methods Families with familial otosclerosis were identified and chracterized clinically. Those which fit the diagnostic criteria for otosclerosis were recurited for this study. Molecular genetic analyses of these families were carried out by genotyping, haplotyping, Sanger sequencing of candidate genes in linked regions and exome sequencing. Results One Family (2081) was solved through identification of a pathogenic variant (FOXL1c.976_990hetdel) in the FOXL1 gene at chromosome (Chr) 16q that was present in all affected individuals. The 15 base pair (bp) deletion was also identified in a second family from Ontario (ON) and the possible pathways involving FOXL1 in the pathogenesis of otosclerosis were suggested. In the second otosclerosis family, three III candidate variants were identified through exome sequencing of the candidate regions under a dominant model. Conclusion I have identified the first otosclerosis gene, FOXL1, a transcription factor involved in the disease pathogenicity. I also identified three possible candidate mutations for a second otosclerosis family. This finding will have a major impact on molecular genetic studies of other otosclerosis families and it will allows for genetic counselling and the possibility for gene therapies in the future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,137
Score d'incertitude au seuil0,995

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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