Induction of IRF-3 and IRF-7 phosphorylation following activation of the RIG-I pathway.
Notice bibliographique
Résumé
The induction of type I interferon (IFN) and the development of the innate antiviral response are mediated by the activation of interferon regulatory factor (IRF)-3 and IRF-7 under the control of the non-canonical kinases TBK-1 and IKKepsilon. The initial sensing of infection by RNA viruses is mediated by the cytoplasmic, retinoic acid inducible gene I (RIG-I), via a Toll-like receptor (TLR) independent signaling pathway. In the present study, we identify key residues involved in IRF-3 and IRF-7 phosphorylation using TAP-tag purification of TBK-1 and IKKepsilon proteins. Based on the identification of an extended sequence motif--SxSxxxS--common to both IRF-3 and IRF-7, an IRF-7 pSer477/479 phosphospecific antibody was generated. Virus infection, TBK-1/IKKepsilon expression or co-expression of different signaling adaptors such as RIG-I, MAVS and TRIF, all stimulated pSer477/479 phosphorylation. Furthermore, the newly identified adaptor of the RIG-I pathway (MAVS/IPS-1/VISA/Cardif) was able to induce IRF and NF-kappaB dependent promoter activity as efficiently as the constitutively active form of RIG-I (DeltaRIG-I). Co-expression of the NS3/4A protease activity of hepatitis C virus however blocked MAVS-mediated gene activation in a dose dependent manner. These studies link RIG-I sensing of viral RNA to downstream kinase signaling and phosphorylation of IRF-3 and IRF-7 via the MAVS/IPS/VISA/Cardif adaptor.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».