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Enregistrement W647511

Identification of a novel p73 protein binding partner, breast cancer associated 3 (BCA3), in gynecological cancer

2009· article· en· W647511 sur OpenAlexaboutno aff
Thy Leung, PK Lee, C. I. Wong, Hys Ngan

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeptidase Inhibition and Analysis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBreast cancerCancerIdentification (biology)MedicineOncologyGynecologyInternal medicineBiology
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The candidate tumor suppressor gene, p73 is a member of p53 family protein. It was predicted to encode a protein with significant similarity to p53. p73 was mapped to the minimal chromosomal region of 1p36 that is recurrently deleted in many types of cancers such as neuroblastoma, breast cancer, squamous cell carcinoma and B-cell lymphoma. Unlike p53, somatic mutation of p73 gene is extremely rare. p73 exists in two forms: the N-terminal transactivation domain containing form (TAp73) and an isoform without the transactivation domain (DNp73). TAp73 exhibits growth inhibitory, tumor suppressive and pro-apoptotic functions while DNp73 promotes oncogenic activity and abolishes the functions of TAp73. Evidence from our previous finding revealed an association between p73 expression and radiosensitivity of cervical cancers and suggested that p73 might play an important role in controlling cellular radiosensitivity. In the present study, we aimed to identify cellular proteins that interact with p73 and contribute to the development of gynecological cancer. Using yeast two hybrid screening with DNp73 as a bait, we identified a Breast Cancer Associated gene 3 (BCA3) as a novel binding partner of p73. BCA3 gene is a novel protein which plays an important role in substrate localization, transcriptional regulation as well as actin cytoskeleton remodeling. Coimmunoprecipitation experiment confirmed the interaction of DNp73 and BCA3 in HEK293 cells whereas BCA3 did not interact with p53. Interestingly, differential binding affinity with BCA3 was detected between TAp73 and DNp73 isoforms. Coexpression of DNp73 and BCA3 showed colocalization of both proteins in the perinuclear region in cervical cancer cell line (SiHa). Furthermore, with RT-PCR using specific primers performed on 7 cervical cancer cell lines, 4 normal cervix cell lines, 10 ovarian cancer cell lines, 7 normal ovary cell lines and 3 endometrial cancer cell lines, BCA3 was expressed at various expression levels in most cell lines tested. Low or no BCA3 expression was detected in 4 ovarian cancer cell lines and 3 endometrial cancer cell lines. In summary, BCA3 is a novel protein binding partner of p73. It interacts with p73 but not p53 suggesting that BCA3 particularly interacts with p73 which may ultimately influence p73 functions. The differential binding affinity of BCA3 among TAp73 and DNp73 implicating that BCA3 might play a unique role in regulating the function of p73 isoforms. Further studies on the molecular mechanism between p73 and BCA3 may give insight into tumor suppressor function of p73 in gynecological cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,336
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
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