Proteoma do baculovírus Anticarsia gemmatalis múltiplo nucleopoliedrovírus em linhagens celulares distintas e comparação da proteína de envelope GP64 em variantes geográficos.
Notice bibliographique
Résumé
A família Baculoviridae compreende um grande e diverso grupo de vírus patogênicos de insetos, com aproximadamente 700 espécies de hospedeiros.Durante o ciclo viral, dois fenótipos são produzidos: o ODV (occlusion derived virus) responsável pela infecção primária do intestino médio da larva de insetos e o BV (Budded vírus) responsável pela infecção sistêmica.No Brasil, desde a década de 1980, o Anticarsia gemmatalis múltiplo nucleopoliedrovírus (AgMNPV) é utilizado como controle biológico viral no controle da lagarta-da-soja Anticarsia gemmatalis.Com o sequenciamento do genoma do AgMNPV-2D, foram confirmadas potencialmente 152 ORFs, com 26 ORFs que codificam para proteínas estruturais, entre elas a glicoproteína 64 (GP64), fundamental para infecção secundária.No entanto, dados a respeito das proteínas presentes nos fenótipos do AgMNPV-2D são escassos.Este estudo objetiva identificar as proteínas estruturais presentes no AgMNPV-2D por duas abordagens distintas de espectrometria de massas.Outro objetivo consistiu em comparar possíveis adaptações contextuais da gp64 de diferentes isolados geográficos do AgMNPV por clonagem, sequenciamento por Sanger e sequenciamento de alta cobertura.Através deste procedimento, identificamos as substituições sinônimas e não sinônimas de gp64 e vimos que ela não suporta a noção de isolamento geográfico dos AgMNPVs amostrados.Também identificamos 44 e 33 proteínas presentes nos fenótipos ODV e BV no AgMNPV-2D, respectivamente.Embora parte das proteínas já havia sido descrita, o que é coerente com outros proteomas da família Baculoviridae, seis proteínas foram identificadas pela primeira vez no ODV e sete delas associadas ao fenótipo BV.Contudo, não foi possível predizer função para as proteínas pobremente categorizadas.Além disso, 11 proteínas celulares foram identificadas no AgMNPV-2D, possivelmente necessárias para infecção viral.Este achado contribui para
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».