Proteoma do baculovírus Anticarsia gemmatalis múltiplo nucleopoliedrovírus em linhagens celulares distintas e comparação da proteína de envelope GP64 em variantes geográficos.
Bibliographic record
Abstract
A família Baculoviridae compreende um grande e diverso grupo de vírus patogênicos de insetos, com aproximadamente 700 espécies de hospedeiros.Durante o ciclo viral, dois fenótipos são produzidos: o ODV (occlusion derived virus) responsável pela infecção primária do intestino médio da larva de insetos e o BV (Budded vírus) responsável pela infecção sistêmica.No Brasil, desde a década de 1980, o Anticarsia gemmatalis múltiplo nucleopoliedrovírus (AgMNPV) é utilizado como controle biológico viral no controle da lagarta-da-soja Anticarsia gemmatalis.Com o sequenciamento do genoma do AgMNPV-2D, foram confirmadas potencialmente 152 ORFs, com 26 ORFs que codificam para proteínas estruturais, entre elas a glicoproteína 64 (GP64), fundamental para infecção secundária.No entanto, dados a respeito das proteínas presentes nos fenótipos do AgMNPV-2D são escassos.Este estudo objetiva identificar as proteínas estruturais presentes no AgMNPV-2D por duas abordagens distintas de espectrometria de massas.Outro objetivo consistiu em comparar possíveis adaptações contextuais da gp64 de diferentes isolados geográficos do AgMNPV por clonagem, sequenciamento por Sanger e sequenciamento de alta cobertura.Através deste procedimento, identificamos as substituições sinônimas e não sinônimas de gp64 e vimos que ela não suporta a noção de isolamento geográfico dos AgMNPVs amostrados.Também identificamos 44 e 33 proteínas presentes nos fenótipos ODV e BV no AgMNPV-2D, respectivamente.Embora parte das proteínas já havia sido descrita, o que é coerente com outros proteomas da família Baculoviridae, seis proteínas foram identificadas pela primeira vez no ODV e sete delas associadas ao fenótipo BV.Contudo, não foi possível predizer função para as proteínas pobremente categorizadas.Além disso, 11 proteínas celulares foram identificadas no AgMNPV-2D, possivelmente necessárias para infecção viral.Este achado contribui para
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.000 | 0.000 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.000 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.001 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".