Data from: Divergent population structure in five common rockfish species of puget sound, WA suggests the need for species-specific management
Notice bibliographique
Résumé
Quantifying connectivity between endangered or threatened marine populations is critical information for scientifically sound management. Of the 86 species managed by the Pacific Fishery Management Council (PFMC) on the West Coast of the United States, over 75% are rockfishes, and of those species, 27 were once deemed ‘at risk’. Although most stocks have been successfully rebuilt along the Washington Coast, Puget Sound stocks have yet to recover despite fisheries closures. The connectivity of Puget Sound stocks to coastal populations is relatively unknown, despite the potential of recruitment subsidies from the coast and considerable interest in reopening many fisheries for recreational use. The importance of accurate connectivity estimates was demonstrated by recent research on two of three Endangered Species Act (ESA) listed species in Puget Sound, which showed that one species was not sufficiently distinct to warrant listing as a separate Puget Sound distinct population segment (DPS). The common assumption of isolation of Puget Sound populations, which stems primarily from research on three hybridizing species, may therefore be erroneous. This study aimed to provide an analysis of the connectivity of five Puget Sound rockfish populations and identify distinct population segments where appropriate. Samples from five species (Black (Sebastes melanops), Yellowtail (S. flavidus), Redstripe (S. proriger), Greenstriped (S. elongatus), and Puget Sound (S. emphaeus)) were collected in three areas within and one area outside of Puget Sound and analyzed at over 12,000 restriction-site associated DNA sequencing (RADseq) loci. We found unique species-specific patterns of genetic diversity, attributable to multiple extrinsic and intrinsic factors. In particular, Black and Puget Sound Rockfish showed no genetic differentiation; Yellowtail and Greenstriped Rockfish were structured according to known geographic barriers; and Redstripe Rockfish revealed evidence for temporal genetic differentiation, suggesting that irregular recruitment influences population structure. None of the species followed the DPS boundaries generally assumed for rockfish, further emphasizing the importance of species-specific management for the effective recovery of these rockfish populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».