Additional file 1 of Biocatalytic cascade to polysaccharide amination
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Figure S1. Acetophenone evaporation at 37 °C. Figure S2. The initial activity of CvATA and SpATA. Figure S3. Absorption spectra of red precipitates formed in the Q-NPEA assay. Figure S4. HPLC results confirming pyruvate depletion. Figure S5. Gel formation by acetyl bond formation in oxidized intermediates. Figure S6. Docking of galactomannan oligosaccharide on SpATA surface before and after alanine substitutions. Figure S7. PGBC in SpATA hosting the PLP cofactor. Figure S8. Discoloration of PLP catalyzed by CvATA. Figure S9. Formation of PMP-derived compounds in the discolored PLP solution. Figure S10. Initial rates of the wild-type SpATA and SpATA E407A measured on pyruvate with varying concentrations. Figure S11. The location of E407A mutation near the interfacial loops. Figure S12. Galactose oxidase inhibition by the aminated product measured using the ABTS assay. Table S1. A list of primers used in the site-directed mutagenesis of SpATA.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,942 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».