Identification and characterization of Trichoderma species from vineyards in British Columbia and studies on their potential use as biological control agents against the grapevine trunk disease Botryosphaeria dieback
Notice bibliographique
Résumé
One of the most important biotic factors limiting grapevine health around the world is grapevine trunk diseases (GTD). Fungal pathogens responsible for GTD infect vines mainly through pruning wounds and cause an overall decline and eventual death of the plant. Currently, there are no chemical fungicides nor biological control agents (BCA) registered in Canada for the control of GTD. Species of Trichoderma are capable of promoting grapevine health and can also protect vines by actively antagonizing plant pathogenic fungi, including GTD pathogens, through several modes of action. Accordingly, the objectives of this research were i) to identify Trichoderma spp. from the Okanagan Valley in British Columbia (BC) by multi-locus gene sequencing and ii) to screen for isolates that can be used as BCA against Diplodia seriata and Neofusicoccum parvum, two of the most prevalent GTD fungi found in BC. In total, 29 Trichoderma isolates were obtained from grapevines in BC. Molecular analyses of the internal transcribed spacer region (ITS1-5.8S-ITS2) of the nuclear ribosomal DNA (rDNA) and a partial sequence of the translation elongation factor 1-alpha gene allowed the identification of seven species, including T. asperelloides, T. atroviride, T. canadense, T. harzianum, T. koningii, T. tomentosum, and T. viticola. Among these, T. canadense and T. viticola are novel species to the scientific community. The antagonistic abilities of Trichoderma species against D. seriata and N. parvum were screened in vitro via dual culture assays and best performing isolates were tested in plantae under greenhouse controlled conditions via detached cane assays alongside commercial pruning wound protectants. The species that performed best under greenhouse conditions were selected to further testing under field conditions in a Merlot vineyard. Trichoderma-based treatments from BC provided >90% reduction of infection when pruning wounds where challenged with the pathogens 1d, 7d, 21d, and 60d post-treatment in the field. Overall, Trichoderma isolates from BC performed similar or better when compared against commercial products. This research represents the initial steps required for the development and registration of local BCA for management of GTD in Canada.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».