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Enregistrement W6910565507 · doi:10.5061/dryad.ksn02v706

The ganglioside, GD2, as a circulating tumor biomarker for neuroblastoma

2019· dataset· en· W6910565507 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueDRYAD · 2019
Typedataset
Langueen
Domaine
Thématique
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNeuroblastomaBiomarkerGanglioneuroblastomaPediatric cancerGanglioneuromaChildhood cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: GD2 is a ganglioside that is ubiquitously expressed in the plasma membrane of neuroblastoma and is shed into the circulation. Procedure: GD2 was measured with a high-pressure liquid chromatography/tandem mass spectrometry assay in serum or plasma from 40 children without cancer (controls) and in biobanked samples from 128 (73 high-risk) children with neuroblastic tumors at diagnosis, 56 children with relapsed neuroblastoma, 14 children with high-risk neuroblastoma after treatment, and 8 to 12 children each with 10 other common childhood cancers at diagnosis. Results: The C18 (18 carbon fatty acid) lipoform was the predominant circulating form of GD2 in controls and in patients with neuroblastoma. The median concentration of GD2 in children with high-risk neuroblastoma at diagnosis was 167 nM (range, 16.1-1060 nM), which was 30-fold higher than the median concentration (5.6 nM) in controls. GD2 was not elevated in serum from children with the differentiated neuroblastic tumors, ganglioneuroma (n = 10) and ganglioneuroblastoma-intermixed subtype (n = 12), and in children with 10 other childhood cancers. GD2 concentrations were significantly higher in serum from children with MYCN-amplified tumors (P = 0.0088), high-risk tumors (P < 0.00001), International Neuroblastoma Staging System (INSS) stage 4 tumors (P < 0.00001), and in children who died (P = 0.034). Conclusions: Circulating GD2 appears to be a specific and sensitive tumor biomarker for highrisk/ high-stage neuroblastoma and may prove to be clinically useful as a diagnostic or prognostic circulating tumor biomarker. GD2 will be measured prospectively and longitudinally in children enrolled on a high-risk neuroblastoma treatment trial to assess its ability to measure response to treatment and predict survival.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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