The genomic basis of adaptation in threespine stickleback fish
Notice bibliographique
Résumé
Evolutionary biology consists in the study of the evolutionary processes responsible of the diversification and adaptation of life forms over time. When adapting to a new environment (or changes in their local environment), populations have to adapt through natural selection. Until recently, the study of adaptation was focusing on fathoming the consequences of natural selection at the phenotypic level and how phenotypic evolution is linked to genetic changes. The development of new genetic and genomic tools in the last 20 years, like high-throughput sequencing technologies, now allows the construction of reference genomes in a variety of non-model organisms and the investigation of the genomic basis of adaptation. In my thesis, I investigated the genomic basis of adaptation by exploring the consequences of natural selection at the molecular level using the threespine stickleback fish (Gasterosteus acualeatus) as a model. \nIn more detail, my work focused on three main topics: the genomic basis of parallel adaptation to acidic versus basic lochs of North Uist (Outer Hebrides, Scotland); the maintenance of standing genetic variation in Atlantic stickleback fish, and the characterization of reproductive isolation at the genomic level between parapatric stickleback populations of the Misty watershed (Vancouver Island, British Columbia, Canada). \n
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».