Pneumococcal Disease Trends in the Post-Vaccine Era in Calgary, Canada: An Interrupted Time Series Analysis
Notice bibliographique
Résumé
Background: In 2002 the 4-dose 7-valent pneumococcal conjugate vaccine (PCV7) was introduced in Calgary for vaccination of children, followed by the 3-dose 13-valent vaccine (PCV13) in 2010. Methods: We conducted an interrupted time series analysis on incidence of IPD per quarter allowing for change in trends in 2002 and 2010. We included models for IPD overall and age and serotype restricted models. Results: The incidence of PCV7 IPD (all ages) decreased after PCV7 introduction in 2002 (P<0.001) and was sustained after PCV13 introduction in 2010. In children, the incidence of PCV13 (less PCV7 ST) IPD increased in children after PCV7 introduction (P<0.001) and decreased after PCV13 introduction (P=0.002). After PCV7 introduction, overall IPD incidence was lower in children, but not significant, (P=0.054) and was unchanged in adults (P=0.4721). After PCV13 introduction, overall IPD incidence was unchanged in children (P=0.88) and increased in adults (P<0.001). Conclusions: PCV7 IPD has declined in the post-PCV period, but overall IPD had not declined significantly and was increasing in adults prior to the precipitous decline observed in 2021, during the COVID-19 pandemic. PCV13 serotypes, as well as non-vaccine serotypes, continue to cause disease, including outbreaks of serotype 4, 5, and 8. It is unclear whether the change from 4 doses to 3 doses of PCV has reduced overall vaccine effectiveness.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,008 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».