Beneath the surface: unraveling Mycobacterium abscessus morphotypes, resistance and clinical challenges in treatment
Notice bibliographique
Résumé
Mycobacterium abscessus (MABS) exhibits resistance mechanisms that share features with Mycobacterium tuberculosis, yet gaps remain in understanding the phenotypic and genotypic aspects of persistent infections. The transition from smooth (S) to rough (R) morphotypes, primarily regulated by the glycopeptidolipid (GPL) gene locus, is associated with reduced GPL levels and increased virulence. In the R morphotype, bacteria form cords that help them evade the host immune response, leading to infection persistence. This study paired culture-based and molecular methods to elucidate the relationship between phenotypic characteristics and genetic determinants in clinical MABS strains isolated from 19 long-term cystic fibrosis patients in Vancouver, Canada. Strains were analyzed using antibiotic testing, lipid analysis, infection modeling and whole-genome sequencing (WGS). Deviations from the previously described S and R morphotypes discrete morphologies were observed, with heterogenous populations found in half of clinical strains. Lipid analysis confirmed GPL profiles matched the assigned morphotypes, except in seven strains that expressed GPL yet were classified as R. A subset of 25 strains from five patients was evaluated for bacterial growth during infection of THP-1 macrophages. Notably, a morphotype transition from S to R was observed in three patients with declining lung function. Contrary to prior observations with reference strains, the R isolates replicated significantly faster than the S isolates in the macrophage infection model. Importantly, the results of the ex vivo macrophage growth assay reliably predicted lung function stability or decline in isolates collected over the course of chronic infections. This study is the first to directly quantify intracellular replication rates and correlate them with pulmonary deterioration. Through the analysis of isogenic pairs and serial isolates, the inherent plasticity of rough strains within and between patients is underscored, manifesting in variable replication rates and increasing drug resistance in later-stage isolates. While the study confirmed the correlation between morphotype and GPL levels, it unveiled greater variability within morphotype groups than previously recognized, particularly during intracellular infection. These findings contribute to the expanding knowledge base surrounding MABS infections, offering insights that can inform future research, diagnostic methodologies, and treatment approaches.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».