ISIS-Fish Database: Life History and Spatial Distribution of Sole, Megrim, Anglerfish, Thornback ray, and Cuckoo ray Populations in the Bay of Biscay
Notice bibliographique
Résumé
In the context of the MACCO project (https://www.macco.fr/), we have developed an ISIS-Fish database with the objective of describing the spatial and monthly life cycle of 7 fish species of commercial interest in the mixed demersal fishery in the Bay of Biscay. In the case of megrim, cuckoo ray, thornback ray, anglerfish and sole, the population dynamics have been described in detail, both by age class and by global model. In addition, the distribution areas of these species according to their life stage have been mapped and included in the database. The settings of Hake and nephrops population dynamics are derived from a previous model (Seanoe https://doi.org/10.17882/86233). The database is accompanied by all the data and information necessary for the reproduction of the results and the assessment of the variability of the system. The biological parameters of each species are presented in summary species sheets with references, and in Excel files that contain all the variability observed in the literature and in the sea survey data. Our mapping work allow an appreciation of the variability between months and years, as illustrated through commented exploratory reports. At the end, the ISIS-Fish database is accompanied by a simulation and a technical validation report, which demonstrate the efficacy of the modelling process as parameterized. The data project includes 1) the ISIS-Fish database and all the ISIS-Fish files required to re-run the simulation of the 7 populations dynamics, 2) the species sheets for megrim, cuckoo ray, thornback ray, anglerfish and sole and 3) the R scripts to reproduce maps of the 5 species. All the data are reproductible using isis-fish-4.4.8.1 (isis-fish.org) and R 4.3.2. WARNING : Due to excessively long file paths, decompression may fail on Windows. To prevent this, please extract the archive directly to a root folder (e.g., C:\).
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,019 | 0,011 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».