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Enregistrement W6929337811 · doi:10.48336/1r61-zg11

Oxylipins as novel sources of soybean (glycine max) tolerance to phytophthora sojae infection

2022· article· en· W6929337811 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhytophthora sojaeOomyceteCultivarPhytophthoraStem rotPathogenRoot rotCrop

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Soybean (Glycine max) is an important staple crop currently grown worldwide. The annual global losses of the crop due to root and stem rot infection caused by oomycete Phytophthora sojae are currently estimated at approximately $2B USD. The attempt to fight this devastating disease is towards pyramiding tolerant soybean cultivars that could enhance tolerance to Phytophthora sojae infection. The initial point of infection is root and could spread to the stem. Lipids are major structural components of cellular membranes, which serve as a component of defense mechanisms used by plants against pathogen infection. I hypothesized that lipid mediated plant immunity including phyto-oxylipin anabolism culminating in unique histochemical and morphological structures appear to be part of the successful mechanisms used by tolerant soybean cultivar to limit colonization and infection by Phytophthora sojae. These greater alterations are just a component of successful strategy used by tolerant cultivar to mitigate pathogen infection. To investigate these hypotheses, we employed multi-modal lipidomics, scanning electron microscopy and histochemical techniques to determine, (1) how soybean cultivars remodel their lipid metabolism, (2) to better understand the induction and functions of phyto-oxylipins, and (3) to investigate the mechanism of infection in both soybean cultivars in response to Phytophthora sojae infection. Both soybean cultivars demonstrated alterations in lipid metabolism in response to pathogen infection. Relative to non-inoculated controls, induced accumulation of stigmasterol occurred in the susceptible cultivar whereas induced accumulation of phospholipids and glycerolipids was observed in the tolerant cultivar. A comprehensive metabolic map of soybean root and stem lipid metabolism identified unique lipid biomarkers and accumulation of phyto-oxylipins in tolerant cultivar in response to Phytophthora sojae infection. Histochemical results revealed differences in morphological changes in both susceptible and tolerant cultivars and seemed to be associated with the successful mechanisms used by tolerant soybeans to limit pathogen infection. Overall, my thesis findings demonstrate the role of lipid metabolisms and phyto-oxylipin induction in soybeans during pathogen inversion. This information could be useful in pyramiding soybean cultivars with high tolerance to Phytophthora sojae infection and may consequently improve sustainable agriculture.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2022
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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