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Enregistrement W6929650010 · doi:10.5061/dryad.96n24g7

Data from: Extra-pair offspring are less heterozygous than within-pair offspring in American redstarts (Setophaga ruticilla)

2019· dataset· en· W6929650010 sur OpenAlexaffabout

Notice bibliographique

RevueData Archiving and Networked Services (DANS) · 2019
Typedataset
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensEnvironment and Climate Change CanadaQueen's UniversityThompson Rivers University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOffspringInbreedingMatingPopulationLoss of heterozygosityOutbreeding depressionSociobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The vast majority of bird species are socially monogamous; however, extra-pair paternity is nearly ubiquitous and a number of theories have been proposed to explain the prevalence of this mixed mating strategy. Here, we test the genetic compatibility hypothesis—the idea that females that are genetically similar to their social partners will mate with extra-pair males that are genetically dissimilar to produce offspring that are more heterozygous. For this study, we examined eight years of paternity data (2004-2011) from a Nearctic-Neotropical migratory bird, the American Redstart (Setophaga ruticilla), breeding in southeastern Ontario, Canada. We predicted that females paired with genetically similar males (higher relatedness) would be more likely to produce extra-pair offspring and that extra-pair offspring would have higher levels of heterozygosity than within-pair offspring. Alternatively, because this population experiences high levels of immigration, females may produce extra-pair offspring with more genetically similar males because of the potential for outbreeding depression. Using five highly variable microsatellite markers, we examined patterns of relatedness among social pairs as well as measures of offspring heterozygosity. In contrast to our predictions, we found no difference in relatedness between social pairs where the females produced extra-pair offspring and social pairs where the females produced only within-pair offspring. However, extra-pair offspring were significantly less heterozygous than within-pair offspring. Together, these findings suggest that females a) are not engaging in extra-pair fertilizations based on relatedness to their social mate and b) appear to be mating with extra-pair males that are more genetically similar to themselves. We suggest there may be benefits for females to mate with genetically similar extra-pair males in highly outbred populations with high rates of immigration, such as for maintaining co-adapted gene complexes or genes coding for local adaptations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Jeu de données · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,086

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreJeu de données

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2019
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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