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Enregistrement W6930689939 · doi:10.5281/zenodo.14509868

Pleurobranchidae Gray 1827

2023· article· en· W6930689939 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2023
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiquePsychological Testing and Assessment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMonophylyCladeParaphylySystematicsMediterranean climateTaxonomy (biology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Systematics of Pleurobranchidae Although not supported in the ML and BI phylogenies, Pleurobranchidae is for the first time recovered as a clade in our analyses. All valid, representative genera within the family are for thefirsttimepresent, namely Bathyberthella, Berthella, Berthellina, Boreoberthella, Pleurehdera, and Pleurobranchus. Berthella is consistently found paraphyletic and four clades classifiable as three different genera are recovered. Bearing that in mind, most genera are found monophyletic with maximum support, although how genera are related to each other is not always well supported. Berthellina is recovered monophyletic with full support, the species B. edwardsii (Vayssière, 1897) from the Mediterranean and Eastern Atlantic (94.3–99% identity) is the sister-group to the Indo-Pacific species. The latter group is composed of B. citrina (Rüppell and Leuckart, 1828) from the Red Sea (100% identity), B. punctata (Quoy and Gaimard, 1832) from Australia, and a clade of B. delicata (Pease, 1861) species with probabl hidden speciation spanning from the Red Sea, the Maldives (Fig. 1E), and Hawaii (90.7–93.6% identity). All Bathyberthella antarctica Willan and Bertsch 1987 (Fig. 1F) specimens from across the Weddell Sea and the Scotia Arc conformed to a monophyletic clade (bs = 100, pp = 1) with a 95–100% identity. A clade containing Berthella perforata (Philippi, 1844) specimens from Italy (99.1–100% identity) and the type species of Berthella, B. plumula (Montagu, 1803), with specimens from the Northeast Atlantic and the Mediterranean Sea (98.7–100% identity) was fully recovered only in the ML analysis (bs = 100). This clade also included B. ocellata (Delle Chiaje, 1830) from Greece (Fig. 1G), B. medietas Burn, 1962 from Australia, B. sideralis Lovén, 1846 from Sweden, and B. platei (Bergh, 1898) from 15 m depth Chile and 250 m depth in the Falkland Islands (99.3– 99.5% identity). A second ‘ Berthella’ clade (bs = 99, pp = 1) is largely composed of the B. stellata (Risso, 1826) group agreeing to the recently recognized species in Ghanimi et al. (2020b) yet adding some more complexity. The B. stellata (Fig. 1I) group is found in tropical and temperate waters from the Eastern Pacific, Caribbean, and Mediterranean seas, including B. andromeda Ghanimi, Schrödl, Goddard et al., 2020, B. strongi (MacFarland, 1966), B. nebula Ghanimi et al., 2020, and B. vialactea Ghanimi et al., 2020. This latter group is sister to a Pacific one composed of B. pellucida (Pease, 1860) from Hawaii, B. cf. postrema from New Caledonia, our newly sequenced B. cf. ‘ stellata ’ from Japan, and Pleurehdera haraldi Ev.Marcus and Er.Marcus, 1970 from Palmyra Atoll in the middle of the Pacific. Since Pleurehdera haraldi is the type and only species of the genus and nests within this second ‘ Berthella ’ clade, we suggest transferring all the above-mentioned species to the genus Pleurehdera. Interestingly, only in the BI analysis, a sister relationship between specimens belonging to Berthella s.s. and the Pleurehdera clade was recovered yet without full support (pp = 0.95). Sister to both B. stellata and the Pacific group we found B. martensi (Pilsbry, 1896), with specimens from Australia and the Pacific side of Panama (99.3% identity) and a likely hidden species from the Maldives (c. 85% identity) (Fig. 1H). This clade deserves the erection of a new genus (see Systematic description). A fourth ‘ Berthella ’ clade (bs = 92, pp = 0.99) is composed of the North Pacific clade that includes specimens of Berthella californica (Dall, 1900) from California to Panama, two specimens of Boreoberthella augusta Martynov and Schrödl 2009 (Fig. 1J) from Japan (100% identity), and Berthella chacei (J.Q.Burch, 1944) from Russia, Canada, and the USA (99–99.7% identity). Given the present phylogenetic scenario and the morphological characters discussed below, we hence establish Boreoberthella californica comb. nov. (Fig. 1K) and Boreoberthella chacei comb. nov. Finally, we recovered a monophyletic clade of Pleurobranchus species (bs = 100, pp = 1) (Fig. 1L), containing the type species P. peronii Cuvier, 1804 and mainly recovering the species groups already studied by Goodheart et al. (2015).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,051

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0150,005

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,102
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

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Publié2023
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