Table 1 in New and interesting species of Penicillium (Eurotiomycetes, Aspergillaceae) in freshwater sediments from Spain
Notice bibliographique
Résumé
Table 1. Strain information and GenBank/EMBL accession numbers of the Penicillium species investigated in this study. SpeciesSectionStrain no.1Substrate and OriginGenBank nucleotide accession no.2:Citationtub 2cmdAITSrpb 2P. ausonanumLanata - DivaricataFMR 16948TFluvial sediment, stream of the Guilleries National Park, Barcelona, Catalonia, SpainLR655809LR655810LR655808LR655811This studyP. guarroiGracilentaFMR 17747TFluvial sediment, Brugent River, Tarragona, Catalonia, SpainLR814134LR814140LR814139LR814145This studyP. heteromorphumExilicaulisCBS 226.89TSoil, ChinaKJ834455KP016786KC411702JN406605Visagie et al. 2014aExilicaulisFMR 18043Fluvial sediment, stream of the Cadí-Moixerò Natural Park, Lleida, Catalonia, SpainLR861780LR861782LR861783LR861784This studyP. irregulareCanescentiaFMR 17859TFluvial sediment, Miraflores River, Community of Madrid, SpainLR814144LR814151LR814181LR814182This studyP. sanguifluumCitrinaCBS 127032TSoil, Calahonda, Costa del Sol, SpainJN606819JN606555JN617681-Houbraken et al. 2011CitrinaFMR 17617Fluvial sediment, Mallorca Island, SpainLR861778LR861781LR861779-This studyCitrinaFMR 17619Fluvial sediment, Mallorca Island, SpainOU375375---This studyP. sicorisParadoxaFMR 18076TFluvial sediment, Segre River, Lleida, Catalonia, SpainLR884494LR884496LR884497LR884495This studyP. submersumRobsamsoniaFMR 17140TFluvial sediment, stream of the Montsant Natural Park, Tarragona, Catalonia, SpainLR814187LR814188LR814194LR814195This studyP. tardochrysogenumChrysogenaCBS 132200 TSoil, McMurdo Dry Valley, AntarcticaJX996898JX996239JX997028JX996634Houbraken et al. 2012ChrysogenaFMR 17137Fluvial sediment, stream of the Montsant Natural Park, Tarragona, Catalonia, SpainHG996463HG996465HG996464-This studyP. vaccaeorumCitrinaCBS 148.83TSandy soil under pine tree, Valladolid, SpainJN606846JN606543MH861558-Houbraken et al. 2011CitrinaFMR 17967Fluvial sediment, Basque Country, SpainLR814226LR814227LR814235-This studyCitrinaFMR 17531Fluvial sediment, stream of Montseny National Park, Barcelona, SpainLR814203LR814204LR814213-This studyCitrinaFMR 17534Fluvial sediment, stream of Montseny National Park, Barcelona, SpainOU375168OU375273OU375272-This studyCitrinaFMR 17616Fluvial sediment, stream of Serra de Tramontana, Mallorca, SpainLR814212LR814218LR814217-This studyCitrinaFMR 18100Fluvial sediment, Segre River, Lleida, SpainLR814234LR814242LR814241-This studyCitrinaFMR 18123Fluvial sediment, Segre River, Lleida, SpainLR814265LR814264LR814273-This studyCitrinaCBS 110.64Forest soil, Erzurum, TurkeyJN606829JN606533MH858377-Houbraken et al. 2011CitrinaCBS 441.88Sandy soil, ChileJN606846JN606568--Houbraken et al. 2011CitrinaCBS 643.73Sandy soil, Manitoba, Canada-JN606576--Houbraken et al. 2011CitrinaCBS 644.73Sandy soil, Manitoba, CanadaLR814213JN606577--Houbraken et al. 2011CitrinaCBS 685.85 (Type of P. lacussarmientei)Sandy soil, Torres del Paine National Park, Tierra del Fuego, ChileJN606855JN606533JN617711-Houbraken et al. 2011CitrinaCBS 300.67Sandy greenhouse soil, The Netherlands-JN606561--Houbraken et al. 2011CitrinaCBS 127029Forest soil, Los Alerces National Park, ArgentinaJN606814-MH864309-Houbraken et al. 2011CitrinaCBS 118024Ants (Camponotus spp.), New Brunswick, CanadaJN606833JN606537--Houbraken et al. 2011 CBS: Culture collection of the Westerdijk Fungal Biodiversity Institute, Utrecht, The Netherlands; FMR: Facultat de Medicina i Ciències de la Salut, Reus, Spain. T Indicate ex-type strains. 1 Strain no.: strain number. 2 tub 2: β-tubulin; cmdA: calmodulin; ITS: Internal transcribed spacer regions of the rDNA and 5.8S region; rpb 2: the DNA dependent RNA polymerase II largest subunit. Novelties and sequences generated in this study are in bold.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,005 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,014 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».