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Enregistrement W6931519529 · doi:10.5281/zenodo.7829420

Marasmius siccus Fr.

2022· article· en· W6931519529 sur OpenAlexaffabout

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2022
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFerroptosis and cancer prognosis
Établissements canadiensRoyal Ontario Museum
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPileusHolotypeBasidiocarpAgaricalesBasidiumAgaricomycetes

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Marasmius siccus (Schwein.) Fr. Epicrisis Systematis Mycologici, seu Synopsis Hymenomycetum: 382 (Fries 1838). — Type: United States. North Carolina (Salem) or Pennsylvania (Bethlehem): “Salem-Beth.”, Schweinitz, no date (holo-,PH[PH00062046]) (based on Desjardin [1989]). Agaricus siccus Schwein., Schriften der Naturforschenden Gesellschaft zu Leipzig 1: 84 (Schweinitz 1822). Chamaeceras siccus (Schwein.) Kuntze, Revisio generum plantarum (Leipzig) 3 (3): 457 (Kuntze 1898). REFERENCE STRAINS. — United States. Tennessee, 19.VII.1991, D.E. Desjardin DED5255 (SFSU[SFSU-F-029078]; GenBank: FJ431272); J.N. Hill JNH010 (TENN[TENN-F-070783]; GenBank: MF686511) as Marasmius fulvoferrugineus; V. Antonín (BRNM[BRNM 552709]; GenBank: HQ607384), published in Antonín et al. (2012). REMARKS Marasmius siccus s. str. regards DED5255, a topotype specimen collected and determined by Dr Dennis E. Desjardin, as the most authentic for the species in the phylogenetic trees (Figs 1; 2). The species is known by the umbrella-like basidiomata (the orange pinwheel) that are somewhat larger and more robust than M. haematocephalus, with a membranous, radially sulcate, yellow-orange-brown pileus (2.5-27 mm diam.) with darker center, a filiform to cylindrical, glabrous, brown stipe ([17-]23-62[-85] × 0.2-1.25 mm) with a floccose basal mycelium, and distant, whitish (15-22) lamellae (lamellulae often absent or 1-2) (Gilliam 1976; Desjardin 1989). Desjardin (1989: 671-674) revised the holotype that singly had oblong, 15.2-20.4 × 3.4-4 µm (n = 13) basidiospores, refractive, well-developed, 32-56 × 5.5-8 µm pleurocystidia, and a pileipellis composed of orangish to brownish Siccustype broom cells. His review of the type specimen (Desjardin 1989: 671-674) as well as the description based on fresh collections (Desjardin 1989: 246-249) agreed with Gilliam (1976), especially in the dimensions of basidiospores (15.2- 20.8 × 3.2-4.6 µm vs [13.3-]16-21[-23] × 2.8-4.2[-5] µm, respectively) and of pleurocystidia (32-60 × 5-9 µm vs 23-67[- 81] × 3-14 µm, respectively). Besides the holotype, examined collections from the United States included in Desjardin (1989) were from Connecticut, Delaware, Idaho, Illinois, Indiana, Kansas, Maryland, Michigan, Minnesota, Nebraska, New Hampshire, New York, North Carolina, Ohio, Pennsylvania, Rhode Island, Tennessee, Vermont, Virginia, West Virginia, Wisconsin, along with one collection from Japan. Gilliam (1976) also included to the list of states in United States collections from the District of Columbia, Massachusetts and Missouri, besides collections from Ontario (Canada) and Japan. So, the North American collections are the preferred starting point to delimit M. siccus. The pantemperate species concept recognizes the taxon as widespread across the subarctic, boreal and temperate zone of the northern hemisphere with circumpolar distribution (Noordeloos 1987; Antonín & Noordeloos 2010) based on collections from Canada, Finland, Norway, Republic of Korea, Russia, Sweden, and United States. This pantemperate M. siccus would cover specimens with larger spores (15-23 × 4-5 µm in Noordeloos [1987] and 15-23.5 × [2.5-]3-4.5[-5] µm in Antonín & Noordeloos [2010]) and larger pleurocystidia (25-70 × 5-10 µmNoordeloos [1987] and 25-80 × 5-21.5 µm in Antonín & Noordeloos [2010]) than those predominantly from North America (Gilliam 1976; Desjardin 1989). Noordeloos (1987) and Antonín & Noordeloos (2010) also included collections from North America that should be M. siccus s. str. This species has been referred as a very variable species, or with a broad concept, or one of the most misapplied binomials of Marasmius (Gilliam 1976; Desjardin 1989; Antonín & Noordeloos 2010), usually confused with M. bellipes Morgan, M. borealis Gilliam, M. glabellus Peck, M. ferrugineus, M. fulvoferrugineus Gilliam, M. pulcherripes and M. robinianus Gilliam. Based on nrITS, the Nearctic M. siccus s. str. (DED5255) is 1.6-3.5 dissimilar to the Palearctic M. siccus lineages. Strains of M. siccus s. str. without preserved basidiomata collection, solely based on the GenBank accessions are: GU328526 (United States, Michigan, 44°48’N, 85°48’W, date unshown, environmental sample “man22_litter_H12” in Edwards & Zak [2010]). Dedicated to the M. siccus complex, a review study of the involved collections in the phylogenetic analyses herein and/or fresh collections should be carried out considering M. siccus s. str. and the other close/cryptic species across the temperate zone based on siccus_cp1 (Figs 1; 2).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,057

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0170,010

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

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Publié2022
Routes d'admission2
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