Additional file 6 of Determinants of substrate specificity in a catalytically diverse family of acyl-ACP thioesterases from plants
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 6: Fig. S3. EI mass spectra of compounds detected in media from K27(DE3) E. coli cultures expressing ALTs. β-keto fatty acids secreted into culture media were chemically decarboxylated to methylketones prior to GC-MS analysis. Standard spectra used for compound identification are shown to the right of sample spectra. Fully reduced free fatty acids and saturated methylketones were identified by comparison to standard spectra from the NIST 17 Mass Spectral Library. Monounsaturated methylketones were identified by comparison to spectra previously obtained by Goh et al. [30]. 3-hydroxy fatty acids were identified based on the presence of their trimethylsilyl (TMS) derivatives in silylated samples. Mass spectra of the 2TMS derivatives of 3-hydroxy fatty acids were compared to standard spectra in the NIST 17 library, with the exception of 7(Z)-3-hydroxyhexadec-7-enoic acid, which is unlisted. The 2TMS derivative of 7(Z)-3-hydroxyhexadec-7-enoic acid was identified based the presence of the molecular ion (m/z = 386) and prominent ion fragments characteristic of both the 2TMS derivative of a 3-hydroxy fatty acid (m/z = 73, m/z = 147, m/z = 233, M+ − 31) and the TMS derivative of a monounsaturated fatty acid (M+ − 169, M+ − 90). Indole, a quorum sensing molecule, was present in media from all induced cultures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,322 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».