Additional file 1 of Plasma lipidomic profiling reveals metabolic adaptations to pregnancy and signatures of cardiometabolic risk: a preconception and longitudinal cohort study
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 1: Fig. S1. Flowchart of sample selection and analysis steps in this study. Fig. S2. Pairwise Pearson correlation coefficient heat map of fasting glucose, 2-h post-load glucose, fasting insulin, HOMA-IR and HbA1c. Fig. S3. Histograms and pair-wise scatter plots of fasting glucose and 2-h post-load glucose concentrations at preconception, pregnancy and postpartum using trio subjects. Fig. S4. Histograms and pair-wise scatter plots of fasting insulin concentration and HOMA-IR at preconception, pregnancy and postpartum using trio subjects. Fig. S5. Histograms and pair-wise scatter plots of glycated haemoglobin (HbA1c, %) at preconception, pregnancy and postpartum using trio subjects. Fig. S6. Forest plots of fasting glucose concentration at postpartum, 2-h post-load glucose concentration at preconception, and HbA1c level at preconception, pregnancy and postpartum. Fig. S7. Scatter plots of effect sizes at preconception, pregnancy and postpartum in the fasting glucose, 2-h post-load glucose, fasting insulin, HOMA-IR association studies. Fig. S8. Venn diagrams of significant lipid species at preconception, pregnancy and postpartum for fasting glucose concentration, 2-h post-load glucose concentration and GDM status based on nominal p-value cut-off and the profiles of six selected lipid species from the 37 preconception signatures of GDM. Fig. S9. Association results of plasma fasting insulin concentration with plasma lipidomic profiles at preconception, pregnancy and postpartum. Fig. S10. Association results of fasting glucose, 2-h post-load glucose, impaired glucose tolerance status, fasting insulin, HOMA-IR and HbA1c levels at preconception. Fig. S11. Scatter plots of effect sizes in the association results of fasting glucose, 2-h post-load glucose, fasting insulin and HOMA-IR at preconception using trio and all subjects. Fig. S12. Percentage of individual lipid species within phosphatidylcholine, phosphatidylethanolamine and phosphatidylinositol classes. Fig. S13. Lipid ratios for enzyme indices of phosphatidylethanolamine n-methyltransferase (PEMT), lecithin-cholesterol acyltransferase (LCAT) and phospholipase A2 (PLA2).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,028 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,766 | 0,073 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».