Supplementary material from "A predominant role of genotypic variation in both expression of sperm competition genes and paternity success in <i>Drosophila melanogaster</i>"
Notice bibliographique
Résumé
Sperm competition is a crucial aspect of male reproductive success in many species, including <i>Drosophila melanogaster,</i> and seminal fluid proteins (Sfps) can influence sperm competitiveness. However, the combined effect of environmental and genotypic variation on sperm competition genes' expression remains poorly understood. Here, we used <i>Drosophila</i> Genetic Reference Panel (DGRP) inbred lines and manipulated developmental population density (i.e. larval density) to test the effects of genotype, environment and genotype-by-environment interactions (GEI) on the expression of the known sperm competition genes <i>Sex Peptide</i>, <i>Acp36DE</i> and <i>CG9997</i>. High larval density resulted in reduced adult body size, but expression of sperm competition genes remained unaffected. Furthermore, we found no significant GEI but genotypic effects in the expression of <i>SP</i> and <i>Acp36DE</i>. Our results also revealed GEI for relative competitive paternity success (second male paternity; P2), with genes’ expression positively correlated with P2. Given the effect of genotype on genes' expression, we conducted a genome-wide association study (GWAS) and identified polymorphisms in putative <i>cis</i>-regulatory elements as predominant factors regulating the expression of <i>SP</i> and <i>Acp36DE</i>. The association of genotypic variation with sperm competition outcomes, and the resilience of sperm competition genes’ expression against environmental challenges, demonstrates the importance of genome variation background in reproductive fitness.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,239 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».