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Enregistrement W6944258956 · doi:10.17863/cam.38935

Genetic and lifestyle risk factors for MRI-defined brain infarcts in a population-based setting.

2019· article· en· W6944258956 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

RevueApollo (University of Cambridge) · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNIH Clinical CenterNational Center for Research ResourcesU.S. National Library of MedicineNational Institute of Neurological Disorders and StrokeUniversity of CincinnatiQueensland Brain InstituteNational Health and Medical Research CouncilDeutsche ForschungsgemeinschaftLeonard M. Miller School of MedicineGöteborgs UniversitetDirectorate for Biological SciencesNational Institutes of HealthCollege of Medicine, University of CincinnatiDementia Centre for Research CollaborationNational Institute on AgingUniversität GreifswaldNIHR Oxford Biomedical Research CentreNational Stroke FoundationVincent Fairfax Family FoundationNational Center for Global Health and MedicineMenzies Institute for Medical ResearchHjartaverndMedizinische Universität GrazPeking Union Medical CollegeSahlgrenska AkademinKarl-Franzens-Universität GrazUniversité de BordeauxBHF Centre of Research Excellence, OxfordDeutsches Zentrum für Neurodegenerative ErkrankungenNational Institute for Health and Care ResearchCenters for Disease Control and PreventionNeuroscience Research AustraliaLeids Universitair Medisch CentrumMcKnight FoundationCentre National de la Recherche ScientifiqueFonds Wetenschappelijk OnderzoekDr. John T. MacDonald FoundationUniversiteit UtrechtLeonard M. Miller School of Medicine, University of MiamiMonash UniversityNational Medical Research CouncilUniversity of GlasgowNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversiteit LeidenMinistero della SaluteCorona-StiftungInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleMurdoch UniversityCentre for Cognitive Ageing and Cognitive EpidemiologyKU LeuvenUniversity of PittsburghUniversity of New South WalesSingapore Eye Research InstituteHunter Medical Research InstituteFondation LeducqUniversity of MiamiUniversity of EdinburghUK-India Education and Research InitiativeMassachusetts General HospitalUniversity College LondonScottish Funding CouncilSkånes universitetssjukhusNational University of SingaporeCommonwealth Scientific and Industrial Research OrganisationInstitute of GeneticsBroad InstituteVlaamse regeringWestern Sydney UniversityBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDuke-NUS Medical SchoolUniversity of OxfordShimane UniversityKaiser Permanente Washington Health Research InstituteAmerican Heart AssociationNational Human Genome Research InstituteUniversity of Texas Health Science Center at HoustonLunds UniversitetUniversity of SydneyNetherlands Heart InstituteJohns Hopkins UniversityWellcome TrustUniversity of WashingtonRoyal Holloway, University of LondonUniversity of TasmaniaPeking Union Medical College HospitalU.S. Department of Veterans AffairsUniversity of PennsylvaniaBristol-Myers SquibbMedical Research CouncilSiemens HealthineersRush UniversityOffice of Research and DevelopmentEuropean CommissionSchool of Medicine, Boston UniversityNational University Health SystemBrigham and Women's HospitalCentre hospitalier régional universitaire de LilleAge UKKaiser PermanenteHáskóli ÍslandsBundesministerium für Bildung und ForschungBritish Heart Foundation
Mots-clésStroke (engine)Diabetes mellitusHyperintensityDiseaseBlood pressureEthnic groupGenetic associationAssociation (psychology)Vascular diseaseEpidemiologyIschemic stroke

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: To explore genetic and lifestyle risk factors of MRI-defined brain infarcts (BI) in large population-based cohorts. METHODS: We performed meta-analyses of genome-wide association studies (GWAS) and examined associations of vascular risk factors and their genetic risk scores (GRS) with MRI-defined BI and a subset of BI, namely, small subcortical BI (SSBI), in 18 population-based cohorts (n = 20,949) from 5 ethnicities (3,726 with BI, 2,021 with SSBI). Top loci were followed up in 7 population-based cohorts (n = 6,862; 1,483 with BI, 630 with SBBI), and we tested associations with related phenotypes including ischemic stroke and pathologically defined BI. RESULTS: The mean prevalence was 17.7% for BI and 10.5% for SSBI, steeply rising after age 65. Two loci showed genome-wide significant association with BI: FBN2, p = 1.77 × 10-8; and LINC00539/ZDHHC20, p = 5.82 × 10-9. Both have been associated with blood pressure (BP)-related phenotypes, but did not replicate in the smaller follow-up sample or show associations with related phenotypes. Age- and sex-adjusted associations with BI and SSBI were observed for BP traits (p value for BI, p [BI] = 9.38 × 10-25; p [SSBI] = 5.23 × 10-14 for hypertension), smoking (p [BI] = 4.4 × 10-10; p [SSBI] = 1.2 × 10-4), diabetes (p [BI] = 1.7 × 10-8; p [SSBI] = 2.8 × 10-3), previous cardiovascular disease (p [BI] = 1.0 × 10-18; p [SSBI] = 2.3 × 10-7), stroke (p [BI] = 3.9 × 10-69; p [SSBI] = 3.2 × 10-24), and MRI-defined white matter hyperintensity burden (p [BI] = 1.43 × 10-157; p [SSBI] = 3.16 × 10-106), but not with body mass index or cholesterol. GRS of BP traits were associated with BI and SSBI (p ≤ 0.0022), without indication of directional pleiotropy. CONCLUSION: In this multiethnic GWAS meta-analysis, including over 20,000 population-based participants, we identified genetic risk loci for BI requiring validation once additional large datasets become available. High BP, including genetically determined, was the most significant modifiable, causal risk factor for BI.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
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