Depth-associated genetic structure within redfish (Sebastes mentella) across the North Atlantic: one broad region, two depth strata, two incipient species?
Notice bibliographique
Résumé
No abstracts are to be cited without prior reference to the author.Genetic and shape analyses of archived otoliths were used for investigating redfish (Sebastes mentella) population structure at depths above and below 500 m, at the scale of the North Atlantic (i.e., Canadian waters, West Greenland shelf, and Irminger Sea). DNA was extracted from 853 archived otoliths sampled in 2009-2011 and was genotyped at 13 microsatellite loci. An individual-based clustering method detected two genetic groups; both groups were observed within each region. Overall, these groups segregated by depth, but (i) juveniles from the genetic 'deep group' were usually found at depth shallower than 500m, in regions close to the continental shelf/slope and (ii) large adult specimens from the genetic 'shallow group' strongly dominated all sampling depths in the southwest Irminger Sea and Flemish Cap. No consistent spatial structure was observed within each group, but introgression with Sebastes fasciatus was observed on the Flemish Cap within the genetic 'shallow-group'. Specimen size disparity between regions resulted in a dominant effect of allometry which confounded otolith shape comparisons between regions. The present study supports the hypothesis of incipient speciation and calls for a better integration of genetic identity, depth, and life-history information into redfish management practices.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».