The New World diversification and origins of the Buckeye butterflies (genus Junonia, Nymphalidae: Nymphalini)
Notice bibliographique
Résumé
The New World buckeye butterflies (genus Junonia) are valuable experimental model organisms, but the taxonomy of this group has been problematic and contentious. I have clarified the taxonomy of the Junonia species in the Western Hemisphere using molecular and morphological data from contemporary and museum collections, with a focus on the South American Junonia species. To do this, I have developed and validated a restriction-digest based digest mode of mitochondrial genotyping for use with both contemporary and historical specimens, An improved taxonomy will encourage and support further comparative biology research in Junonia. I have also explored the hypothesis that Junonia populations in the New World comprise a ring species, but this notion is not valid as geneflow between species is ongoing and contrary to the predictions of the ring species hypothesis, no discontinuity in gene flow was detected based on mitochondrial genotype data. To clarify the relationships among Junonia species and address the issue of the origins of the New World Junonia, an extensive molecular phylogenetic analysis was completed using both full mitogenome and nuclear rRNA repeat sequences. Like previous molecular phylogenies based on much smaller data sets, the species level relationships of the New World Junonia were inconclusive because they were obscured by recent divergence of lineages and gene flow between species. Based on full mitogenome and rRNA repeat phylogenies, I was able to add additional support for a trans-Pacific route of Asian species responsible for the New World Junonia diversification, though some data suggest that genetic contributions from trans-Atlantic migrants from other Junonia lineages is also possible. The New World Junonia may be an example of lineage hybridization contributing to rapid diversification and adaptive radiation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».