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Enregistrement W6949649084 · doi:10.5281/zenodo.16570721

Burnsius communis

2025· article· en· W6949649084 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubspeciesCladePhylogenetic treeRange (aeronautics)Gene flow

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Subspecies of Burnsius communis (Grote, 1872) Currently, Burnsius communis (Grote, 1872) (type locality in USA: central Alabama) is partitioned into two subspecies: the nominate, distributed throughout most of the range from Canada to Mexico; and Burnsius communis albescens (Plötz, 1884) (type locality in Mexico), known from the southern parts of the range (e.g., Oaxaca and Veracruz in Mexico). In line with this treatment, B. communis albescens is a confidently supported sister to all other populations (98% bootstrap value) in the nuclear genome tree constructed from more than 10 million positions in autosome protein-coding genes (Fig. 14a). However, due to their overall lack of prominent genetic differentiation and continuing gene flow within a species, subspecies do not always stand out as major clades in phylogenetic trees. Accordingly, the clade of B. communis albescens specimens, although supported with 100% ultra-fast bootstrap value (Minh et al. 2013), is found within the nominate clade in the Z chromosome tree (Fig. 14b), likely due to poor phylogenetic resolution (low support for most bifurcations) caused by DNA similarity and gene flow. We note that mitochondrial DNA does not consistently segregate several species of Burnsius Grishin, 2019 (type species Syricthus [sic] communis Grote, 1872), such as B. communis, B. albezens Grishin, 2022 (type locality in USA: AZ, Cochise Co.), and B. burnsi Grishin, 2022 (type locality in Mexico: Veracruz), and its utility is equally limited for subspecies delimitation. Additional sequencing of B. communis specimens across the range revealed that specimens from Stanislaus National Forest in Tuolumne County, California, were partitioned between different clades (Fig. 14 yellow highlight). While several specimens were in a confidently supported (99%–100% bootstrap value) nuclear genome clade of specimens from the northwestern part of the range, one specimen was in a clade that included more western and southern specimens. This latter specimen was collected at the same locality and on the same day with one of the specimens from the northwestern clade (near Mill Creek Campground, elevation 6525’, GPS 38.312 6, −119.939 8, 21-Jul-2022, W. R. Dempwolf leg.). These specimens were different in size and wing pattern (Fig. 15h vs. Fig. 15l). Moreover, a similar scenario was later found for four specimens of the same size from south of Lake Tahoe, El Dorado County, California, with two being in the northwestern clade and two (collected several miles to the east) falling in the southeastern clade (Fig. 14 orange highlight; Fig. 15j, k, m, n). Therefore, the northwestern and southeastern clades represent different taxa. Although it is possible that they are species-level taxa, it is also possible that they may be subspecies that intergrade at certain localities and elevations. Currently, several taxa with similar relationships are treated as subspecies (type localities in parentheses): Hesperia colorado sublima A. Warren & Calhoun, 2015 (USA: Colorado, Clear Creek Co.) vs. Hesperia colorado colorado (Scudder, 1874) (USA: Colorado, Lake Co.) and Apodemia virgulti dialeucoides J. Emmel, T. Emmel & Pratt, 1998 vs. Apodemia virgulti nigrescens J. Emmel & T. Emmel, 1998 (both USA: California, San Bernardino Co.) (Pelham 2023). Hence, and due to the lack of prominent genetic differentiation characteristic of species, the new taxa of Burnsius are conservatively described here as subspecies of B. communis, pending more detailed analyses and further studies. Warren (2005) reviewed Oregon populations and also noted phenotypic differences among them.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
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