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Enregistrement W6949898688 · doi:10.5281/zenodo.2617679

Dysregulation of poly ADP ribose signaling in HD and its potential as a therapeutic target

2019· article· en· W6949898688 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueZenodo (CERN European Organization for Nuclear Research) · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePARP inhibition in cancer therapy
Établissements canadiensUniversity of TorontoMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHuntingtinDNA damageDNA repairDNAPoly ADP ribose polymeraseOxidative phosphorylationProgrammed cell deathMitochondrionPolymerase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Huntington’s disease (HD) age of onset is correlated to CAG repeat length within the disease-causing gene but varies by decades between individuals. Genetic causes for this disease modification were linked to DNA repair, redox regulation, and mitochondrial health pathways by genome-wide association studies. The huntingtin protein responds to reactive oxygen species by moving to the nucleus where it localizes to sites of DNA damage and acts as a scaffold for DNA repair factors. We therefore sought to identify huntingtin-interacting proteins in the context of oxidative stress. We found a large degree of overlap with databases of proteins modified by poly ADP ribose (PAR), the moiety generated upon activation of poly ADP ribose polymerases (PARPs) by DNA damage. We show that purified huntingtin protein binds PAR in vitro and that huntingtin co-immunoprecipitates PARylated proteins upon oxidative stress. We and others have previously observed elevated levels of DNA damage in HD cells and tissues, which may reflect suboptimal huntingtin function as a DNA repair factor scaffold. Unrepaired DNA damage leads to prolonged activation of PARPs and overproduction of PAR. We therefore examined PAR levels in HD patient-derived fibroblasts and found them to be elevated compared to controls. Unrelenting PAR production causes ATP depletion, mitochondrial failure and energy crisis through multiple mechanisms, providing a link between GWAS genetic modifier pathways and long-observed energy deficits in HD. PAR also acts as a mediator of cell death through parthanatos. Current efforts are therefore focused on determining whether inhibition of PAR production can alleviate ATP/ADP ratio phenotypes and cell death in HD cells. We seek to determine if PARP enzymatic inhibition, or suppression of PARP expression is the target for HD. Recent reports of the role of PAR in Parkinson’s and other neurodegenerative diseases suggests a common pathogenic mechanism and that repurposing PARP inhibitors, some of which have been developed and FDA-approved as cancer drugs, may provide a viable therapeutic strategy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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