Additional file 2 of Molecular characterization of Streptococcus suis isolates recovered from diseased pigs in Europe
Notice bibliographique
Résumé
Additional file 2. Comparative architecture of cps loci in untypable Streptococcus suis isolates. Illustrated is the genetic organization of the cps loci of the five S. suis untypable isolates, including a comparison to appropriate reference cps loci sequences. Percentage identity to reference sequences is indicated. A) ST28 isolates NSUI00643 and NSUI00644, both recovered in Hungary, possessed some but lacked several key cps genes found in the reference ST28 serotype 2 strain NSUI002 (GenBank accession number CP011419.1). B) ST2796 isolate NSUI00607, recovered in France, possessed some but lacked several key cps genes found in serotype 31 strain 92-4172 (GenBank accession number AB737835.1). C) ST2790 isolate NSUI00477, recovered in the Netherlands, possessed some but lacked several key cps genes found in reference serotype 1 strain 5428 (GenBank accession number JF273644.1). D) ST2798 isolate NSUI00633, recovered in France, possessed some but lacked several key cps genes found in reference serotype 28 strain 89-590 (GenBank accession number AB737832.1).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,020 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,836 | 0,149 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».