Effects of\nGenetics and Environment on the Metabolome of Commercial Maize Hybrids:\nA Multisite Study
Notice bibliographique
Résumé
This study was designed to elucidate the biological variation\nin\nexpression of many metabolites due to environment, genotype, or both,\nand to investigate the potential utility of metabolomics to supplement\ncompositional analysis for substantial equivalence assessments of\ngenetically modified (GM) crops. A total of 654 grain and 695 forage\nsamples from 50 genetically diverse non-GM DuPont Pioneer maize hybrids\ngrown at six locations in the U.S. and Canada were analyzed by coupled\ngas chromatography time-of-flight-mass spectrometry (GC/TOF-MS). A\ntotal of 156 and 185 metabolites were measured in grain and forage\nsamples, respectively. Univariate and multivariate statistical analyses\nwere employed extensively to compare and correlate the metabolite\nprofiles. We show that the environment had far more impact on the\nforage metabolome compared to the grain metabolome, and the environment\naffected up to 50% of the metabolites compared to less than 2% by\nthe genetic background. The findings from this study demonstrate that\nthe combination of GC/TOF-MS metabolomics and comprehensive multivariate\nstatistical analysis is a powerful approach to identify the sources\nof natural variation contributed by the environment and genotype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».