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Enregistrement W6966546345 · doi:10.48336/g7eq-zc03

The role of thiol-redox protein modifications in ROS-dependent metabolic reprogramming during germination suppression in wheat seeds

2024· article· en· W6966546345 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

RevueMemorial University Research Repository (Memorial University) · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSeed Germination and Physiology
Établissements canadiensMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAleuroneGerminationAbscisic acidCaryopsisReactive oxygen speciesSproutingOxidative phosphorylationReprogrammingProteomics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pre-harvest sprouting (PHS) is a recurring problem for wheat growers worldwide. However, the molecular mechanisms underlying PHS remain elusive. Redox changes in seed tissues and reactive oxygen species-based triggers are essential for seed germination, with plant NADPH oxidases (NOXs) playing an important role. This study demonstrated the link between ROS production, cellular oxidative metabolism, and sensitivity to external ABA in white-seeded spring wheat. In this study, pharmacological treatments using Diphenylene iodonium (DPI), an inhibitor of NOXs, abscisic acid (ABA) phytohormone, and their combination were used to inhibit germination in freshly harvested (FH) and after-ripened (AR) wheat seeds from doubled haploid (DH) lines with non-dormant genotype. Changes to embryo and aleurone thiol-redoxomes during germination suppression were identified and quantified using iodoTMT labeling, nano-liquid chromatography tandem mass spectrometry (nanoLC-MS/MS) analysis in conjunction with IWGSC RefSeq and EST wheat databases. The thiol-redoxomes were studied using two different approaches, analyzing changes in reversibly modified proteins (RMPs) (approach I) and in Cys-containing differentially abundant proteins (CysDAPs) (approach II). FH wheat seeds showed higher germination resistance (GR) response to ABA treatment in the presence of DPI as compared to AR seeds. In FH tissues, all RMPs were up-regulated in the reduction level, and most CysDAPs increased in abundance during ABA-mediated germination inhibition under oxidative stress. Most thiol-responsive proteins in FH embryos were involved in cellular respiration, protein biosynthesis and lipid metabolism. High number of storage- and pathogen-responsive proteins were identified in FH aleurones. In contrast to FH tissues, AR tissues contained a minimal amount of RMPs and CysDAPs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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