The role of thiol-redox protein modifications in ROS-dependent metabolic reprogramming during germination suppression in wheat seeds
Notice bibliographique
Résumé
Pre-harvest sprouting (PHS) is a recurring problem for wheat growers worldwide. However, the molecular mechanisms underlying PHS remain elusive. Redox changes in seed tissues and reactive oxygen species-based triggers are essential for seed germination, with plant NADPH oxidases (NOXs) playing an important role. This study demonstrated the link between ROS production, cellular oxidative metabolism, and sensitivity to external ABA in white-seeded spring wheat. In this study, pharmacological treatments using Diphenylene iodonium (DPI), an inhibitor of NOXs, abscisic acid (ABA) phytohormone, and their combination were used to inhibit germination in freshly harvested (FH) and after-ripened (AR) wheat seeds from doubled haploid (DH) lines with non-dormant genotype. Changes to embryo and aleurone thiol-redoxomes during germination suppression were identified and quantified using iodoTMT labeling, nano-liquid chromatography tandem mass spectrometry (nanoLC-MS/MS) analysis in conjunction with IWGSC RefSeq and EST wheat databases. The thiol-redoxomes were studied using two different approaches, analyzing changes in reversibly modified proteins (RMPs) (approach I) and in Cys-containing differentially abundant proteins (CysDAPs) (approach II). FH wheat seeds showed higher germination resistance (GR) response to ABA treatment in the presence of DPI as compared to AR seeds. In FH tissues, all RMPs were up-regulated in the reduction level, and most CysDAPs increased in abundance during ABA-mediated germination inhibition under oxidative stress. Most thiol-responsive proteins in FH embryos were involved in cellular respiration, protein biosynthesis and lipid metabolism. High number of storage- and pathogen-responsive proteins were identified in FH aleurones. In contrast to FH tissues, AR tissues contained a minimal amount of RMPs and CysDAPs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».