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Enregistrement W6981963332

Functional validation of the genetic architecture of «Salmonella» persistence in 129S6 mice and the impact of Ses1 (Nramp1) on the transcriptome of «Salmonella» enteritidis during chronic carriage

2012· other· en· W6981963332 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2012
Typeother
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueSouth Asian Studies and Conflicts
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSalmonella enteritidisCongenicSalmonellaSpleenVirulenceComplementationTranscriptomeSalmonella entericaQuantitative trait locus
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Salmonella Typhimurium and Salmonella Enteritidis cause a food-borne disease resulting in gastroenteritis. To study the persistence of Salmonella during the late phase of infection, a mouse model was developed using C57BL/6J mice that clear the bacteria completely from the spleen and lymph nodes within 42 days post-infection and 129S6 mice that become chronic carriers. Linkage analyses using a cross between C57BL/6J and 129S6 mice led to the mapping of ten quantitative trait loci, Ses1 to Ses10, affecting Salmonella persistence in mice. In the females, Ses3 showed significant effects on bacterial clearance and two significant interactions between Ses1.2 and Ses4 and between Ses1.2 and Ses5. To functionally validate in vivo the interaction between Ses1.2 and Ses4 or Ses5, we created double congenic mice. Bacterial counts in the spleen and the liver demonstrated that both the 129S6.B6-Ses1.2/Ses4 and the 129S6.B6-Ses1.2/Ses5 mice clear Salmonella Enteritidis more efficiently than 129S6 or single congenic mice at day 42 post-infection validating the interaction terms identified by statistical analyses. We also tested the candidacy of Hamp as the gene underlying Ses5 by quantitative complementation test in which we did not detect a significant interaction between Hamp and Ses5. In addition, the effect of Nramp1 on the Salmonella expression of virulence factors, notably mgtB and phoP was investigated ex vivo and in vivo. To validate our hypothesis in vivo, we present the creation of ΔmgtB and ΔphoPQ Salmonella Enteritidis mutants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,291
Score d'incertitude au seuil0,988

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,165
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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