MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W6982311043

IDENTIFIKASI MYXOBOLUS SP PADA FAMILI CYPRINIDAE DENGAN METODE MOLEKULER DI PROVINSI JAWA TIMUR DAN JAWA TENGAH

2016· dissertation· id· W6982311043 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueUniversitas Airlangga Repository (Universitas Airlangga) · 2016
Typedissertation
Langueid
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMyxozoan Parasites in Aquatic Species
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMyxobolusGrass carpCypriniformesLawsonia intracellularis
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Data morfometri yang digunakan untuk mengidentifikasi Myxobolus sp pada
\nfamili Cyprinidae yang berasal dari Jawa Timur dan Jawa Tengah menunjukkan adanya
\nvarian perbedaan bentuk dan ukuran spora, sedangkan pada jumlah coil filament belum
\ndapat ditentukan dengan pasti. Namun apabila diamati menggunakan fase kontras dapat
\ndiperkirakan jumlah coil filament sekitar 7 – 9. Hasil penelitian menunjukkan bahwa
\ngejala klinis yang terlihat adanya nodul pada insang yang berwarna putih atau
\nkemerahan dan memenuhi rongga insang sehingga operculum tidak dapat menutup
\ndengan sempurna, gerakan ikan tidak aktif, sisik geripis dan warna tubuh agak
\npucat/gelap. Penyakit parasit Myxobolus sp ditemukan menginfeksi famili Cyprinidae
\nyaitu pada ikan mas, ikan koi dan ikan komet pada ukuran benih 3-10 cm. Secara
\nmorfometri ukuran Myxobolus sp yang ditemukan menginfeksi ikan komet (Carassius
\nauratus) pada umumnya lebih panjang ± 1-2 μm, namun secara keseluruhan tidak
\nmenunjukan perbedaan yang signifikan. Primer yang digunakan untuk amplifikasi
\nmerupakan primer spesifik pada 18S rDNA untuk mendeteksi Myxobolus sp dengan
\nmenggunkan Primer ERIB1 dan ERIB10 (Barta et al.,1997). Berdasarkan hasil
\npemeriksaan PCR diperoleh pada proses suhu yang sama dengan beberapa tahapan
\nannealing yang berbeda 55ºC dan 59 ºC, berdasarkan hasil elektroforesis pemeriksaan
\nPCR (Polymerase Chain Reaction) fragmen DNA menunjukkan di 2034 bp, secara
\nmolekuler semua organ sampel yang digunakan pada penelitian ini menunjukkan positif
\nterinfeksi Myxobolus sp, yang selanjutnya dapat dilakukan proses sekuensing.
\nDari hasil BLAST didapat bahwa sampel Myxobolus tersebut secara genetik
\nmempunyai 3 kedekatan identity dengan M. ampullicapsulatus (95%), M. koi (92% dan
\n96%), M. Koi isolate MTR20110316 (93% dan 95%). Keseluruhan sekuen tersebut
\ndialignment menggunakan aplikasi ClustalW pada software MEGA versi 6. Selanjutnya
\ndari hasil alignment dapat digunakan untuk menyusun pohon filogenetik. Analisa
\nfilogenetik dilakukan dengan menggunakan Neighbor-Joining method version 3.6a2.1,
\ntidak ada outgroup root.
\nHasil filogenetik diatas juga dapat mendukung hipotesa yang menyatakan bahwa
\nspesies Myxobolus tergabung menjadi satu monofiletik yaitu kedalam famili
\nMyxobolidae, spesies tersebut dari hasil Neighbor joining yang kemudian dibandingkan
\ndengan literatur untuk jenis Myxobolus koi isolate MTR20110316 (Accession
\nKJ725077.1) berasal dari Eropa dan Asia, M. Pendula berasal dari Ontario dan M.
\nampullicapsulatus berasal dari China. Selain itu juga banyak dari spesies yang terdaftar
\npada GenBank merupakan spesies Myxobolus pada famili cyprinidae.
\nKata kunci : Identifikasi Myxobolus sp pada famili Cyprinidae.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMéta-épidémiologie (sens strict)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,428
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0030,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueUniversitas Airlangga Repository (Universitas Airlangga)Même sujetMyxozoan Parasites in Aquatic SpeciesTravaux en français237 207