IDENTIFIKASI MYXOBOLUS SP PADA FAMILI CYPRINIDAE DENGAN METODE MOLEKULER DI PROVINSI JAWA TIMUR DAN JAWA TENGAH
Notice bibliographique
Résumé
Data morfometri yang digunakan untuk mengidentifikasi Myxobolus sp pada \nfamili Cyprinidae yang berasal dari Jawa Timur dan Jawa Tengah menunjukkan adanya \nvarian perbedaan bentuk dan ukuran spora, sedangkan pada jumlah coil filament belum \ndapat ditentukan dengan pasti. Namun apabila diamati menggunakan fase kontras dapat \ndiperkirakan jumlah coil filament sekitar 7 – 9. Hasil penelitian menunjukkan bahwa \ngejala klinis yang terlihat adanya nodul pada insang yang berwarna putih atau \nkemerahan dan memenuhi rongga insang sehingga operculum tidak dapat menutup \ndengan sempurna, gerakan ikan tidak aktif, sisik geripis dan warna tubuh agak \npucat/gelap. Penyakit parasit Myxobolus sp ditemukan menginfeksi famili Cyprinidae \nyaitu pada ikan mas, ikan koi dan ikan komet pada ukuran benih 3-10 cm. Secara \nmorfometri ukuran Myxobolus sp yang ditemukan menginfeksi ikan komet (Carassius \nauratus) pada umumnya lebih panjang ± 1-2 μm, namun secara keseluruhan tidak \nmenunjukan perbedaan yang signifikan. Primer yang digunakan untuk amplifikasi \nmerupakan primer spesifik pada 18S rDNA untuk mendeteksi Myxobolus sp dengan \nmenggunkan Primer ERIB1 dan ERIB10 (Barta et al.,1997). Berdasarkan hasil \npemeriksaan PCR diperoleh pada proses suhu yang sama dengan beberapa tahapan \nannealing yang berbeda 55ºC dan 59 ºC, berdasarkan hasil elektroforesis pemeriksaan \nPCR (Polymerase Chain Reaction) fragmen DNA menunjukkan di 2034 bp, secara \nmolekuler semua organ sampel yang digunakan pada penelitian ini menunjukkan positif \nterinfeksi Myxobolus sp, yang selanjutnya dapat dilakukan proses sekuensing. \nDari hasil BLAST didapat bahwa sampel Myxobolus tersebut secara genetik \nmempunyai 3 kedekatan identity dengan M. ampullicapsulatus (95%), M. koi (92% dan \n96%), M. Koi isolate MTR20110316 (93% dan 95%). Keseluruhan sekuen tersebut \ndialignment menggunakan aplikasi ClustalW pada software MEGA versi 6. Selanjutnya \ndari hasil alignment dapat digunakan untuk menyusun pohon filogenetik. Analisa \nfilogenetik dilakukan dengan menggunakan Neighbor-Joining method version 3.6a2.1, \ntidak ada outgroup root. \nHasil filogenetik diatas juga dapat mendukung hipotesa yang menyatakan bahwa \nspesies Myxobolus tergabung menjadi satu monofiletik yaitu kedalam famili \nMyxobolidae, spesies tersebut dari hasil Neighbor joining yang kemudian dibandingkan \ndengan literatur untuk jenis Myxobolus koi isolate MTR20110316 (Accession \nKJ725077.1) berasal dari Eropa dan Asia, M. Pendula berasal dari Ontario dan M. \nampullicapsulatus berasal dari China. Selain itu juga banyak dari spesies yang terdaftar \npada GenBank merupakan spesies Myxobolus pada famili cyprinidae. \nKata kunci : Identifikasi Myxobolus sp pada famili Cyprinidae.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».