MétaCan
Menu
Back to cohort
Record W6982311043

IDENTIFIKASI MYXOBOLUS SP PADA FAMILI CYPRINIDAE DENGAN METODE MOLEKULER DI PROVINSI JAWA TIMUR DAN JAWA TENGAH

2016· dissertation· id· W6982311043 on OpenAlexaboutno aff

Bibliographic record

VenueUniversitas Airlangga Repository (Universitas Airlangga) · 2016
Typedissertation
Languageid
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicMyxozoan Parasites in Aquatic Species
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsMyxobolusGrass carpCypriniformesLawsonia intracellularis
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

Data morfometri yang digunakan untuk mengidentifikasi Myxobolus sp pada
\nfamili Cyprinidae yang berasal dari Jawa Timur dan Jawa Tengah menunjukkan adanya
\nvarian perbedaan bentuk dan ukuran spora, sedangkan pada jumlah coil filament belum
\ndapat ditentukan dengan pasti. Namun apabila diamati menggunakan fase kontras dapat
\ndiperkirakan jumlah coil filament sekitar 7 – 9. Hasil penelitian menunjukkan bahwa
\ngejala klinis yang terlihat adanya nodul pada insang yang berwarna putih atau
\nkemerahan dan memenuhi rongga insang sehingga operculum tidak dapat menutup
\ndengan sempurna, gerakan ikan tidak aktif, sisik geripis dan warna tubuh agak
\npucat/gelap. Penyakit parasit Myxobolus sp ditemukan menginfeksi famili Cyprinidae
\nyaitu pada ikan mas, ikan koi dan ikan komet pada ukuran benih 3-10 cm. Secara
\nmorfometri ukuran Myxobolus sp yang ditemukan menginfeksi ikan komet (Carassius
\nauratus) pada umumnya lebih panjang ± 1-2 μm, namun secara keseluruhan tidak
\nmenunjukan perbedaan yang signifikan. Primer yang digunakan untuk amplifikasi
\nmerupakan primer spesifik pada 18S rDNA untuk mendeteksi Myxobolus sp dengan
\nmenggunkan Primer ERIB1 dan ERIB10 (Barta et al.,1997). Berdasarkan hasil
\npemeriksaan PCR diperoleh pada proses suhu yang sama dengan beberapa tahapan
\nannealing yang berbeda 55ºC dan 59 ºC, berdasarkan hasil elektroforesis pemeriksaan
\nPCR (Polymerase Chain Reaction) fragmen DNA menunjukkan di 2034 bp, secara
\nmolekuler semua organ sampel yang digunakan pada penelitian ini menunjukkan positif
\nterinfeksi Myxobolus sp, yang selanjutnya dapat dilakukan proses sekuensing.
\nDari hasil BLAST didapat bahwa sampel Myxobolus tersebut secara genetik
\nmempunyai 3 kedekatan identity dengan M. ampullicapsulatus (95%), M. koi (92% dan
\n96%), M. Koi isolate MTR20110316 (93% dan 95%). Keseluruhan sekuen tersebut
\ndialignment menggunakan aplikasi ClustalW pada software MEGA versi 6. Selanjutnya
\ndari hasil alignment dapat digunakan untuk menyusun pohon filogenetik. Analisa
\nfilogenetik dilakukan dengan menggunakan Neighbor-Joining method version 3.6a2.1,
\ntidak ada outgroup root.
\nHasil filogenetik diatas juga dapat mendukung hipotesa yang menyatakan bahwa
\nspesies Myxobolus tergabung menjadi satu monofiletik yaitu kedalam famili
\nMyxobolidae, spesies tersebut dari hasil Neighbor joining yang kemudian dibandingkan
\ndengan literatur untuk jenis Myxobolus koi isolate MTR20110316 (Accession
\nKJ725077.1) berasal dari Eropa dan Asia, M. Pendula berasal dari Ontario dan M.
\nampullicapsulatus berasal dari China. Selain itu juga banyak dari spesies yang terdaftar
\npada GenBank merupakan spesies Myxobolus pada famili cyprinidae.
\nKata kunci : Identifikasi Myxobolus sp pada famili Cyprinidae.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame distilled prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. Learned from the 10,348 direct Codex labels and 10,348 direct Gemma labels. Candidate is the union of thresholded teacher heads; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels or direct frontier model labels.

metaresearch head score (Codex)0.001
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: codex-gemma-dda1882f352aValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesMeta-epidemiology (narrow), Science and technology studies, Research integrity, Insufficient payload (model declined to judge)
Consensus categoriesMeta-epidemiology (narrow)
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.428
Threshold uncertainty score1.000

Codex and Gemma teacher scores by category

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0010.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0020.003
Meta-epidemiology (broad)0.0020.002
Bibliometrics0.0010.001
Science and technology studies0.0020.001
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0030.001
Research integrity0.0030.001
Insufficient payload (model declined to judge)0.0010.001

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.006
GPT teacher head0.216
Teacher spread0.210 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; both teacher heads agree on what is shown here.

Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2016
Admission routes1
Has abstractyes

Explore more

Same venueUniversitas Airlangga Repository (Universitas Airlangga)Same topicMyxozoan Parasites in Aquatic SpeciesFrench-language works237,207