Identifying patterns of influenza A genotypes in wild birds
Notice bibliographique
Résumé
Wild bird reservoirs of influenza A contribute to the overall genetic diversity of influenza, an increased range of endemic areas, as well as, transmission methods not commonly seen in human infections. These additions to influenza transmission increase the threat posed to human populations. Therefore, understanding the patterns of transmission of influenza A subtypes in avian hosts, as well as the environmental variables associated with transmission, is paramount to creating effective surveillance programs and forecasting potential areas of high genetic changes. Using a dataset of ~151,000 birds sample for avian influenza in the US and Canada from 1986-2017, we explore spatial patterns of influenza genotypes and model the environmental niches where certain types are found. Cluster analysis and niche modeling indicate overlap but also imperfect concordance between where each subtype of avian influenza was found and where each was predicted to circulate in wild bird populations. Overall, the Midwest and New England regions indicate higher risks of influenza A in wild birds across all flu types. In addition, the urban, wetland, and water land-cover types, as well as, low levels of human population density increase the likelihood of influenza presence in the avian populations. These results indicate that influenza transmission in wild birds is heavily affected by the activities of humans as well as the general characteristics of land cover types. Together, these results allow researchers to gain a better understanding of the spatial mechanisms of the broad scale patterns associated with influenza and the areas of particular risk associated with subtypes.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».