Rôle de l'acétylation du facteur de transcription IRF3
Notice bibliographique
Résumé
L’immunité innée est notre premier mécanisme de défense contre l’invasion des\npathogènes. Cette défense est basée sur la reconnaissance d’éléments invariables\ndes pathogènes par des récepteurs encodés dans les lignées germinales. Dans la\nréponse anti-virale, le facteur de transcription Interferon Regulatory Factor 3\n(IRF3) joue un rôle clé dans la réponse interféron de type I, combattant ainsi la\nréplication virale et conférant un état anti-viral aux cellules infectées ainsi qu’aux\ncellules avoisinantes. IRF3 est une protéine dont l’activation et la\nphosphorylation sont régulées par les kinases TBK1 et IKKi. Nous proposons ici\nque l’acétylation est une modification post-traductionnelle importante dans la\nrégulation de l’activité d’IRF3. Nous avons observé par immunobuvardage\nqu’IRF3 est acétylé de façon basale et que cette acétylation est induite par la\nprésence du co-facteur CBP et est inhibée par la présence de la kinase TBK1. Par\nspectrométrie de masse, nous avons ensuite identifié huit lysines sujettes à\nl’acétylation sur IRF3. Aussi, par mutagénèse dirigée, nous avons muté de façon\nponctuelle chacun de ces sites et avons déterminé que la mutation de la lysine 87\ninhibe la capacité d’IRF3 à s’attacher à l’ADN en EMSA et à transactiver son\nélément de réponse en essai luciférase. Aussi, nous proposons que l’acétylation\nmasque la charge positive de la lysine 87 et contrôle de façon négative l’activité\ndu facteur de transcription IRF3. Notre groupe démontre ainsi pour la première\nfois l’acétylation du facteur de transcription dans un modèle cellulaire et propose\nque ce processus joue un rôle inhibiteur dans la régulation de la protéine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».