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Enregistrement W6986731599

Rôle de l'acétylation du facteur de transcription IRF3

2012· other· fr· W6986731599 sur OpenAlexvenueno aff

Notice bibliographique

RevueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2012
Typeother
Languefr
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMachine Learning in Bioinformatics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscription factorTranscription (linguistics)InterferonActivating transcription factorGeneral transcription factor
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

L’immunité innée est notre premier mécanisme de défense contre l’invasion des\npathogènes. Cette défense est basée sur la reconnaissance d’éléments invariables\ndes pathogènes par des récepteurs encodés dans les lignées germinales. Dans la\nréponse anti-virale, le facteur de transcription Interferon Regulatory Factor 3\n(IRF3) joue un rôle clé dans la réponse interféron de type I, combattant ainsi la\nréplication virale et conférant un état anti-viral aux cellules infectées ainsi qu’aux\ncellules avoisinantes. IRF3 est une protéine dont l’activation et la\nphosphorylation sont régulées par les kinases TBK1 et IKKi. Nous proposons ici\nque l’acétylation est une modification post-traductionnelle importante dans la\nrégulation de l’activité d’IRF3. Nous avons observé par immunobuvardage\nqu’IRF3 est acétylé de façon basale et que cette acétylation est induite par la\nprésence du co-facteur CBP et est inhibée par la présence de la kinase TBK1. Par\nspectrométrie de masse, nous avons ensuite identifié huit lysines sujettes à \nl’acétylation sur IRF3. Aussi, par mutagénèse dirigée, nous avons muté de façon\nponctuelle chacun de ces sites et avons déterminé que la mutation de la lysine 87\ninhibe la capacité d’IRF3 à s’attacher à l’ADN en EMSA et à transactiver son\nélément de réponse en essai luciférase. Aussi, nous proposons que l’acétylation\nmasque la charge positive de la lysine 87 et contrôle de façon négative l’activité\ndu facteur de transcription IRF3. Notre groupe démontre ainsi pour la première\nfois l’acétylation du facteur de transcription dans un modèle cellulaire et propose\nque ce processus joue un rôle inhibiteur dans la régulation de la protéine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,829
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,137
Écart entre enseignants0,135 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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