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Record W6986731599

Rôle de l'acétylation du facteur de transcription IRF3

2012· other· fr· W6986731599 on OpenAlexvenueno aff

Bibliographic record

VenueLibrary and Archives Canada (Government of Canada) · 2012
Typeother
Languagefr
FieldBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
TopicMachine Learning in Bioinformatics
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsTranscription factorTranscription (linguistics)InterferonActivating transcription factorGeneral transcription factor
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

L’immunité innée est notre premier mécanisme de défense contre l’invasion des\npathogènes. Cette défense est basée sur la reconnaissance d’éléments invariables\ndes pathogènes par des récepteurs encodés dans les lignées germinales. Dans la\nréponse anti-virale, le facteur de transcription Interferon Regulatory Factor 3\n(IRF3) joue un rôle clé dans la réponse interféron de type I, combattant ainsi la\nréplication virale et conférant un état anti-viral aux cellules infectées ainsi qu’aux\ncellules avoisinantes. IRF3 est une protéine dont l’activation et la\nphosphorylation sont régulées par les kinases TBK1 et IKKi. Nous proposons ici\nque l’acétylation est une modification post-traductionnelle importante dans la\nrégulation de l’activité d’IRF3. Nous avons observé par immunobuvardage\nqu’IRF3 est acétylé de façon basale et que cette acétylation est induite par la\nprésence du co-facteur CBP et est inhibée par la présence de la kinase TBK1. Par\nspectrométrie de masse, nous avons ensuite identifié huit lysines sujettes à\nl’acétylation sur IRF3. Aussi, par mutagénèse dirigée, nous avons muté de façon\nponctuelle chacun de ces sites et avons déterminé que la mutation de la lysine 87\ninhibe la capacité d’IRF3 à s’attacher à l’ADN en EMSA et à transactiver son\nélément de réponse en essai luciférase. Aussi, nous proposons que l’acétylation\nmasque la charge positive de la lysine 87 et contrôle de façon négative l’activité\ndu facteur de transcription IRF3. Notre groupe démontre ainsi pour la première\nfois l’acétylation du facteur de transcription dans un modèle cellulaire et propose\nque ce processus joue un rôle inhibiteur dans la régulation de la protéine.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame machine prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: Bench or experimental
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.011
Threshold uncertainty score0.037

Distilled classifier scores by category (both heads)

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0010.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.001
Bibliometrics0.0000.000
Science and technology studies0.0010.001
Scholarly communication0.0010.001
Open science0.0000.000
Research integrity0.0010.002
Insufficient payload (model declined to judge)0.0110.003

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.002
GPT teacher head0.137
Teacher spread0.135 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2012
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