ROLE OF GUT MICROBIOTA IN THE EPISODIC NATURE OF SYMPTOMS IN IRRITABLE BOWEL SYNDROME
Notice bibliographique
Résumé
Irritable Bowel Syndrome (IBS) is a gut-brain-axis disorder with a prevalence of 5.8% in Canada and 3.8% globally. Despite evidence suggesting complex interactions among neural, immune, and epithelial cells, influenced by factors such as diet, microbiota, and stress, the pathophysiology of IBS remains incompletely understood. Key knowledge gaps include the irregular nature of symptoms and the specific bacterial taxa responsible for symptom generation. Therefore, this thesis aims to perform an integrated analysis of a longitudinal study to investigate the relationship between IBS symptom dynamics, gut microbiota composition, and metabolite profiles, to determine whether temporal changes in microbiota predict or drive IBS symptoms. Clustering analysis identified distinct patterns in symptom occurrence and progression, categorizing samples into clusters that captured changes in both gut and mood symptoms, and distinguishing between symptom flares and remission. Subjects with constipation-predominant IBS exhibited consistently higher levels of symptoms while diarrhea-predominant IBS subjects showed varying symptom levels among abnormal stool weeks and normal stool weeks. Examining parallel changes in symptom scores and microbiota beta diversity over time, we found a significant correlation between the two in only 25% of IBS subjects in our cohort. This suggests a potential link between microbiota composition and symptom variability in specific subsets of patients, highlighting the heterogeneity in the microbiota-symptom relationship. Integrated microbiota-metabolite analysis revealed signatures linked to IBS subtypes, with bacteria such as Lachnoclostridium and Olsenella ,and metabolites like chenodeoxycholic acid among others identified as key nodes in network analysis. In conclusion, this study offers comprehensive insights into the episodic nature and heterogeneity of IBS, revealing dynamic symptom patterns and persistent burdens across subtypes. The findings highlight the complex relationship between microbiota composition changes and symptom variation, as well as the microbiota-metabolite axis in IBS patients.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».