Search for genetic markers associated with tolerance and/or susceptibility of cattle to African trypanosomosis
Notice bibliographique
Résumé
L'objectif de cette thèse était d'identifier des marqueurs génétiques associés à la tolérance/sensibilité des bovins aux trypanosomoses africaines. Des analyses d'association entre marqueurs microsatellites et phénotype trypanotolérant (contrôle de l'hématocrite) ont été réalisées sur une population de bovins métis taurins Baoulé/Zébu peul élevés en conditions naturelles au Sud-ouest du Burkina Faso. Les marqueurs microsatellites utilisés étaient localisés dans quatre régions QTL (Quantitative Trait Loci) préalablement identifiés comme liés au contrôle de l'anémie ou de la parasitémie chez des métis N'Dama/zébu Boran. Le déséquilibre de liaison (DL) a été estimé par les mesures D', r' et à partir de données génotypiques et haplotypiques. Les résultats obtenus ont montré une grande diversité génétique en termes de nombre moyen d'allèles par locus, d'hétérozygoties et un faible DL s'étendant sur une courte distance comparativement aux populations bovines européennes sélectionnées. L'ANOVA a montré qu'un allèle du marqueur MNB-42 est significativement associé à ce phénotype (FDR = 0.011). La recherche de signatures de sélection, effectuée sur des taurins africains trypanotolérants, des zébus africains et des taurins européens trypanosensibles, en utilisant des tests basés sur la réduction de la variabilité des marqueurs microsatellites entre les populations trypanotolérantes et les populations trypanosensibles d'une part et des tests basés sur la différentiation génétique d'autre part, a permis de détecter des marqueurs qui s'écartent de l'hypothèse d'évolution neutre et qui sont donc vraisemblablement liés à des locus sélectionnés. Nos résultats confortent l'hypothèse selon laquelle la sélection naturelle a contribué au développement de la trypanotolérance chez les taurins ouest-africains.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».