Search for genetic markers associated with tolerance and/or susceptibility of cattle to African trypanosomosis
Bibliographic record
Abstract
L'objectif de cette thèse était d'identifier des marqueurs génétiques associés à la tolérance/sensibilité des bovins aux trypanosomoses africaines. Des analyses d'association entre marqueurs microsatellites et phénotype trypanotolérant (contrôle de l'hématocrite) ont été réalisées sur une population de bovins métis taurins Baoulé/Zébu peul élevés en conditions naturelles au Sud-ouest du Burkina Faso. Les marqueurs microsatellites utilisés étaient localisés dans quatre régions QTL (Quantitative Trait Loci) préalablement identifiés comme liés au contrôle de l'anémie ou de la parasitémie chez des métis N'Dama/zébu Boran. Le déséquilibre de liaison (DL) a été estimé par les mesures D', r' et à partir de données génotypiques et haplotypiques. Les résultats obtenus ont montré une grande diversité génétique en termes de nombre moyen d'allèles par locus, d'hétérozygoties et un faible DL s'étendant sur une courte distance comparativement aux populations bovines européennes sélectionnées. L'ANOVA a montré qu'un allèle du marqueur MNB-42 est significativement associé à ce phénotype (FDR = 0.011). La recherche de signatures de sélection, effectuée sur des taurins africains trypanotolérants, des zébus africains et des taurins européens trypanosensibles, en utilisant des tests basés sur la réduction de la variabilité des marqueurs microsatellites entre les populations trypanotolérantes et les populations trypanosensibles d'une part et des tests basés sur la différentiation génétique d'autre part, a permis de détecter des marqueurs qui s'écartent de l'hypothèse d'évolution neutre et qui sont donc vraisemblablement liés à des locus sélectionnés. Nos résultats confortent l'hypothèse selon laquelle la sélection naturelle a contribué au développement de la trypanotolérance chez les taurins ouest-africains.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.000 | 0.001 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.000 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.001 |
| Science and technology studies | 0.000 | 0.000 |
| Scholarly communication | 0.001 | 0.000 |
| Open science | 0.000 | 0.000 |
| Research integrity | 0.000 | 0.000 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.001 | 0.000 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".