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Enregistrement W6989342215

The architecture of the ERI complex involved in initiating endogenous RNA interference in «C.elegans»

2009· dissertation· en· W6989342215 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2009
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Mechanisms and Therapy
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRNA interferenceDicerGene silencingEndogenyGeneHelicasePlasma protein bindingRNA silencing
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

RNA interference (RNAi) is a gene silencing mechanism occurring in a wide variety of organisms.Different RNAi pathways exist in C. elegans for the regulation of various endogenous processes.The ERI-mediated RNAi pathway involves the ERI proteins and C. elegans Dicer, DCR-1, suggested to be involved in initiating endogenous RNAi.In this study, it was observed that many of the ERI proteins co-fractionate with DCR-1 in a complex of ~885 kDa in size.It was shown that the RdRP RRF-3 and the Tudor domain protein ERI-5 require each other in order to associate with DCR-1, but independently of ERI proteins ERI-1 and ERI-3.Furthermore, it was also observed that the helicase DRH-3 requires RRF-3 and ERI-5 in order to associate to DCR-1.The data suggested that at least two distinct binding sites for ERI proteins are found on DCR-1.Preliminary GST pulldown data confirmed distinct binding regions on DCR-1 for ERI-5 and ERI-3. III RsumL"ARN interference (RNAi) est un mcanisme de "silencing" de l"expression gnique se produisant chez de nombreux organismes.Chez C. elegans, il existe diffrentes voies RNAi rgulant de nombreuses fonctions biologiques.La voie dpendant d"ERI implique les protines de la famille ERI et DCR-1, l"orthologue de Dicer chez C. elegans, qui pourraient tre engages dans l"initiation du processus RNAi endogne.Durant mon Master, j"ai pu observer que beaucoup de protines ERI co-fractionnent avec DCR-1 au sein de complexes de 885kDa.La protine RdRP RRF-3 et ERI-5, une protine possdant deux domaines Tudor, sont interdpendantes pour l"association avec DCR-1 mais de manire indpendante d"ERI-1 et ERI-3.En outre, j"ai pu galement dmontrer que l"hlicase DRH-3 requiert RRF-3 et ERI-5 pour se fixer DCR-1.L"ensemble de ces donnes suggre qu"il existe au moins deux sites de fixation aux protines ERI sur la protine DCR-1.Enfin, mes rsultats prliminaires de GST-pulldown semblent confirmer la fixation d"ERI-3 et ERI-5 au niveau de rgions distinctes de DCR-1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,440
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle