Host factors associated with HPV infection in Inuit Women of Northern Quebec
Notice bibliographique
Résumé
Background: The Human Leukocyte Antigen (HLA) complex, which is a set of genes involved in the identification of foreign antigens and activation of the immune system, has been proposed as a possible co-factor in HPV infections. Objectives:To determine the frequencies of HLA alleles, haplotypes and genotypes in a cohort of Inuit women in Nunavik, Quebec. The association between these alleles and haplotypes and HPV incidence, period prevalence, persistence, multiple infections and Squamous Intraepithelial Lesions (SILs) will be investigated.Methods:A cohort of 548 Inuit women seeking routine care and living in four different communities of Nunavik was assembled (2002-2010). Cervical specimens were taken at each visit and tested for HPV-DNA. HPV genotypes were classified by oncogenic potential as well as by alpha-papillomavirus species. The HLA alleles were typed using DNA extracted from cervical samples taken at cohort entry. All odds ratios and rate ratios were adjusted for age. Results:The most common HLA class I and class II alleles were HLA-E*0103 (66.4%) and HLA-DQB1*03 (94.2%), respectively. Three HLA-G alleles were prevalent in this population: HLA-G*010401 (50.4%), HLA-G*010101 (31.4%), and HLA-G*010102 (15.2%). HLA-G*010102 was associated with a significantly decreased risk of overall (OR=0.64 95% CI=0.42-0.98) and low risk (LR) (OR=0.37 95% CI=0.16-0.83) HPV period prevalence. HLA-G*010101 (and its homozygous and heterozygous genotypes) were associated with an increased risk of LR alpha group 1 and 3. The homozygous HLA-G*010401 genotype was associated with a decreased risk of LR alpha group 3 infection. No HLA alleles, haplotypes or genotypes were significantly associated with HPV persistence. The HLA-DRB1*13 allele was associated with an increased risk of any SIL and LGSIL. Conclusions:The distribution of HLA alleles and haplotypes in a population of Nunavik, Quebec is different from that found in other Canadian populations, which included women of varied ethnicities. Several alleles (G*010101, G*010102, and G*010401) were associated with HPV period prevalence, but no alleles were significantly associated with HPV persistence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».