The mirB ferrisiderophore transporter of Aspergillus fumigatus: Structural requirements for activity
Notice bibliographique
Résumé
Siderophores (iron chelators) have been identified as virulence factors in the opportunistic fungal pathogen, Aspergillus fumigatus (Afu). The 14-pass transmembrane protein MirB is postulated to function as a siderophore-transporter, responsible for uptake of the siderophore TAFC. The aim of my research was to identify amino acids in the extracellular loops of Afu MirB that are crucial for uptake of Fe-TAFC. Site-directed mutagenesis was used to create MirB mutants and expression of the WT and mutant proteins in Saccharomyces cerevisiae strain PHY14 was confirmed by western blotting. TAFC transport assays using 55Fe-labelled TAFC and growth assays with Fe-TAFC as the sole iron source identified alanine 125, tyrosine 577, loop 3 and the second half of loop 7 as crucial for function, since their substitution or deletion abrogated uptake completely. This study has revealed critical residues important for TAFC uptake which could represent potential targets for the development of novel antifungals.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».