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Enregistrement W6995938107

Potential association between the functional variant RS2043556 in MIR605 gene and development of multiple primary tumors in TP53 P.ARG337HIS mutation carriers pacientes do Rio Grande do Sul

2020· other· en· W6995938107 sur OpenAlexaboutno aff

Notice bibliographique

RevueLume (Universidade Federal do Rio Grande do Sul) · 2020
Typeother
Langueen
DomaineDentistry
ThématiqueDental Health and Care Utilization
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGermlineGenotypeAlleleSNPGermline mutationMutationGeneGenetic predispositionFounder effect
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Li-Fraumeni and Li-Fraumeni-like syndromes (LFS/LFL) are cancer predisposition syndromes associated with TP53 germline mutations and characterized by high risk for multiple early-onset cancers.In Southern and Southeastern Brazil, a founder germline mutation located in the oligomerization domain of the TP53 gene and with incomplete penetrance, c.1010G>A (p.Arg337His), has been detected in many families showing a predisposition to at least some of the cancers of the LFS/LFL spectrum.Recently, the functional variant rs2043556 (A>G), located in MIR605 gene, was identified as a novel genetic modifier of the LFS phenotype in families with classical hotspot TP53 mutations (DNA binding domain mutations).Indeed, miR-605 is a component in the p53 regulatory network, being transcriptionally activated by p53 and post-transcriptionally repressing Mdm2 (a well-known negative regulator of p53 expression levels and activity).Here, we determined the frequency and explored possible effects of the SNP rs2043556 on clinical manifestations of Brazilian individuals carrying TP53 p.Arg337His mutation.Genotyping was performed by allelic discrimination using TaqMan assay and statistical analyzes were conducted on SPSS V.18.0 software.Among 233 patients harboring the founder TP53 mutation, the variant G-allele was detected in 132 (56.7%), of which 23 in homozygosis (GG genotype, 9.9%).Although this SNP was associated with an earlier mean age of tumor onset in LFS patients (classic phenotype) from a Canadian population, this effect was not replicated in our cohort (P = 0.6).A possible reason for this conflicting result is because there were no LFS/LFL families with this highly-prevalent Brazilian mutation evaluated in the previous study.The MIR605 rs204356 genotype was also not associated with the tumor type diagnosed in TP53 p.Arg337His mutation carriers (P = 0.4).However, the GG genotype showed a borderline modifier effect (P = 0.049) to the manifestation of multiple primary tumors in the same group.Among these TP53 p.Arg337His and rs204356[GG]-positive patients with tumor diagnosis in multiple primary sites, a female patient developed very early-onset breast and thyroid cancers (at 23 and 25 years, respectively).To our knowledge, this is the first description of LFS/LFL patients with the variant G-allele of MIR605 rs204356 in homozygosis.Further functional studies are necessary to clarify the effects of this variant in cancer pathways.Uniterms

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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