Quantitative Approaches to the Cancer Stem Cell Hypothesis
Notice bibliographique
Résumé
In this thesis, phenotype switching in cancer cell populations is modeled. We focus on the behavior of cells at the phenotypic level and present mathematical models to capture the results of available experiments. The models, based on the cancer stem cell hypothesis (in addition to the new concept of plasticity in tumor populations), are also employed to predict cancer cell growth in vitro and in vivo. \nThe models are analyzed in the two limits of large and small cell numbers. We use stochastic analysis to capture the random behavior of cells in the limit of low number as observed in mammosphere formation assays (MFAs). Stochastic analysis is employed to estimate quantities such as survival rate while the deterministic solution of the models is obtained to simulate the average behavior of cells. The importance of stochastic analysis and deterministic simulations is discussed in detail. \nThe primary purpose of the thesis is to highlight the importance of stochastic analysis in cancer stem cell experiments. The models are developed or modified based on the idea that both stochastic and deterministic behavior of cells should be considered simultaneously. In order to describe the behavior of the cells in cancer stem cell assays, the developed models are then used to investigate the possible experimental errors in the area and suggest possible filtration methods for corresponding experiments. In addition, the models are used to investigate the behavior of tumors under radiotherapy; and the effects of phenotype switching on the efficiency of therapies are investigated in the final part of the thesis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».