The role of transcription and splicing on histone H3 lysine 4 trimethylation dynamics
Notice bibliographique
Résumé
Histone H3 lysine 4 trimethylation (H3K4me3) is a histone post-translational modification that is normally located near the transcription start site and first 5’ splice site of a gene. Enzymes are involved in regulating the addition and removal of H3K4me3 along the length of the gene body. However, little is understood about these changes during transcriptional induction. Additionally, the effects of splicing inhibition have not been examined in an endogenous system. We hypothesized that transcription and pre-mRNA splicing at the 5’ coding region plays a role in H3K4me3 dynamics. Chromatin immunoprecipitation assays ± splicing (isoginkgetin) or transcription (5,6-dichloro-1-beta-D-ribofuranosylbenzimidazole) inhibitors were done to determine the H3K4me3 levels along the immediate early gene Fos. The gene was stimulated with epidermal growth factor, and monitored at various times. H3K4me3 levels increased and decreased along the induced Fos gene. Inhibition of transcription or splicing prevented these changes in H3K4me3 levels during transcription, suggesting that splicing may influence H3K4me3 levels indirectly. The significance of these finding is that it provides a better understanding of how H3K4me3 is regulated during transcription and splicing of a gene.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».