Veegerelateerde MRSA; epidemiologie in dierlijke productieketens, transmissie naar de mens en karakterisering van de kloon
Notice bibliographique
Résumé
In 2005 werd voor het eerst melding gemaakt van personen die met mrsa besmet waren geraakt door contact met varkens. Deze Nederlandse bevinding leidde tot een ‘pilotstudy’ bij negen slachthuizen waaruit bleek dat 39 procent van de varkens en 81 procent van de slacht-‘batches’ drager was van mrsa. Al de geïsoleerde stammen behoorden tot een specifieke kloon die niet typeerbaar was met de tot dan toe door het rivm gebruikte standaardgenotyperingsmethode (Pulsed Field Gel Electroforesis met SmaI). Daarom werd aanvankelijk de naam niet typeerbare mrsa (nt-mrsa) geïntroduceerd. Ook werd de naam varkensmrsa gebruikt vanwege het voorkomen van de bacterie in varkens. Omdat nu bekend is dat de kloon ook voorkomt in andere productiedieren, wordt de term veegerelateerde mrsa gebruikt (internationaal: Livestock Associated mrsa (la-mrsa)). Recent is in China en Maleisië echter nog een andere mrsa-kloon gevonden die in Azië een brede verspreiding lijkt te hebben onder varkens. la-mrsa beperkt zich dus niet tot de specifieke kloon (‘sequence type’ (st) 398) die voorkomt in Europa, de Verenigde Staten en Canada.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,009 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».