Veegerelateerde MRSA; epidemiologie in dierlijke productieketens, transmissie naar de mens en karakterisering van de kloon
Bibliographic record
Abstract
In 2005 werd voor het eerst melding gemaakt van personen die met mrsa besmet waren geraakt door contact met varkens. Deze Nederlandse bevinding leidde tot een ‘pilotstudy’ bij negen slachthuizen waaruit bleek dat 39 procent van de varkens en 81 procent van de slacht-‘batches’ drager was van mrsa. Al de geïsoleerde stammen behoorden tot een specifieke kloon die niet typeerbaar was met de tot dan toe door het rivm gebruikte standaardgenotyperingsmethode (Pulsed Field Gel Electroforesis met SmaI). Daarom werd aanvankelijk de naam niet typeerbare mrsa (nt-mrsa) geïntroduceerd. Ook werd de naam varkensmrsa gebruikt vanwege het voorkomen van de bacterie in varkens. Omdat nu bekend is dat de kloon ook voorkomt in andere productiedieren, wordt de term veegerelateerde mrsa gebruikt (internationaal: Livestock Associated mrsa (la-mrsa)). Recent is in China en Maleisië echter nog een andere mrsa-kloon gevonden die in Azië een brede verspreiding lijkt te hebben onder varkens. la-mrsa beperkt zich dus niet tot de specifieke kloon (‘sequence type’ (st) 398) die voorkomt in Europa, de Verenigde Staten en Canada.
Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.
How this classification was reachedexpand
Full frame machine prediction
Teacher imitationNot calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. The Gemma side is a direct model label for every work in the frame, read from the title-only record. The Codex side is a classifier learned from the 10,348 direct Codex labels and calibrated to design-weighted sample rates; fields without enough sample support carry no Codex call. Candidate is the union of the two sides; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels.
Distilled classifier scores by category (both heads)
| Category | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Metaresearch | 0.003 | 0.004 |
| Meta-epidemiology (narrow) | 0.001 | 0.000 |
| Meta-epidemiology (broad) | 0.000 | 0.000 |
| Bibliometrics | 0.001 | 0.002 |
| Science and technology studies | 0.001 | 0.001 |
| Scholarly communication | 0.003 | 0.001 |
| Open science | 0.000 | 0.001 |
| Research integrity | 0.001 | 0.001 |
| Insufficient payload (model declined to judge) | 0.009 | 0.001 |
Machine scores (provisional)
The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.
Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.
score_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from itClassification
machine, unvalidatedMachine predicted; a candidate call from one source (direct Gemma or distilled Codex), not a consensus.
How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".