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Enregistrement W6999223465

Characterization of a carbon source-dependent, phytohormone-responsive, free methionine-(R)-sulfoxide reductase from Komagataeibacter hansenii

2021· dissertation· en· W6999223465 sur OpenAlexaff

Notice bibliographique

Revuee-scholar@UOIT (University of Ontario Institute of Technology) · 2021
Typedissertation
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial metabolism and enzyme function
Établissements canadiensOntario Tech University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReactive oxygen speciesMethionine sulfoxide reductaseBacterial celluloseOxidative stressMutantExtracellularSugarBacteriaBiosynthesis
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Komagataeibacter hansenii ATCC 23769 is a gram negative, non-pathogenic, acetic acid bacterium, best known for its ability to produce bacterial cellulose (BC). BC, an extracellular polysaccharide, is an important component of biofilms as it promotes anchoring to surfaces for nutrient acquisition and protection from environmental stress. BC has been long studied however, there is a lack of research pertaining to the regulation of BC production. In this thesis, the functional role of a putative free methionine sulfoxide reductase (MsrC) was characterized using a knockout mutant. The growth of the mutant was greatly affected by the presence of ethylene, abscisic acid and indole-3-acetic acid while oxidative stress increased BC production. Fructose-grown cultures produced more reactive oxygen species than in glucose. Oxidative stress upregulated genes involved with survival, growth, cellulose production, and stress defense. Therefore, MsrC is both phytohormone and oxidative stress responsive, coordinating cellular functions such as growth and BC production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,187
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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