Characterization of the zinc cluster transcription factor Rds2 in «Saccharomyces cerevisiae» links glucose metabolism to antifungal drug resistance
Notice bibliographique
Résumé
In Saccharomyces cerevisiae, zinc cluster proteins constitute the major family of transcriptional regulators for a variety of metabolic processes, yet the function of many are currently unknown. Previous studies have characterized Rds2 as a zinc cluster transcription factor that plays a role in antifungal drug resistance, but an exact mechanism is undefined. However, it has been established that Rds2 is a major regulator of gluconeogenesis. In this study, we aim to further mechanistically characterize the role of Rds2 in antifungal drug resistance. Microarray-based expression profiling of both wild type and ∆rds2 strains treated with ketoconazole indicates a greater than 2-fold decreased expression of genes involved in gluconeogenesis and the glyoxylate cycle, such as PCK1, YIG1, and MLS1, in cells lacking Rds2. Quantitative real-time polymerase chain reaction (qPCR) confirmed our microarray data. Furthermore, deletion of these metabolic genes confers azole hypersensitivity. Our preliminary results show that Rds2's role as a regulator of gluconeogenesis and the glyoxylate cycle is linked to its role in antifungal drug resistance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».